Pacote: eigensoft (8.0.0+dfsg-2 e outros)

[ Fonte: eigensoft  ]

reduction of population bias for genetic analyses

The EIGENSOFT package combines functionality from the group's population genetics methods (Patterson et al. 2006) and their EIGENSTRAT stratification method (Price et al. 2006). The EIGENSTRAT method uses principal components analysis to explicitly model ancestry differences between cases and controls along continuous axes of variation; the resulting correction is specific to a candidate marker's variation in frequency across ancestral populations, minimizing spurious associations while maximizing power to detect true associations. The EIGENSOFT package has a built-in plotting script and supports multiple file formats and quantitative phenotypes.

Outros pacotes relacionados a eigensoft

• dep: libblas3

  Implementações de Referências Básicas de Álgebra Linear , Biblioteca compartilhada

  ou libblas.so.3

  pacote virtual fornecido por libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: liblapack3

  Biblioteca de rotinas de álgebra linear 3 - versão compartilhada

  ou liblapack.so.3

  pacote virtual fornecido por liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

• rec: gnuplot

  programa de plotagem interativo e de linha de comando
  também um pacote virtual fornecido por gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

Download de eigensoft

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	8.0.0+dfsg-2+b1	506.9 kB	3,922.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	8.0.0+dfsg-2+b1	471.2 kB	4,386.0 kB	[lista de arquivos]
armel	8.0.0+dfsg-2+b1	406.4 kB	3,585.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	8.0.0+dfsg-2+b1	394.2 kB	2,741.0 kB	[lista de arquivos]
i386	8.0.0+dfsg-2+b1	500.3 kB	3,848.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	8.0.0+dfsg-2+b1	473.2 kB	4,672.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	8.0.0+dfsg-2+b1	533.6 kB	5,474.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	8.0.0+dfsg-2+b1	506.6 kB	3,406.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	8.0.0+dfsg-2+b1	507.6 kB	4,614.0 kB	[lista de arquivos]