Package: med-bio-dev (3.8.1)

[ Source: debian-med  ]

Debian Med-pakker til udvikling af bioinformatikprogrammer

Denne metapakke vil installere Debianpakker, som kan være nyttige til udvikling af programmer indenfor biologisk forskning.

Tags: Field: Biology, Role: Metapackage, Application Suite: Debian, Purpose: Need an extra tag

Other Packages Related to med-bio-dev

• dep: med-config (= 3.8.1)

  Debian Med - generel konfigurationspakke

• dep: med-tasks (= 3.8.1)

  Debian Med-opgaver for tasksel

• rec: bio-tradis

  Analyser resultatet fra TraDIS-analyser med genomsekvenser

• rec: biobambam2

  Værktøjer for tidlig trin behandling af sammenligningsfil

• rec: bioperl

  Perlværktøjer til modellering af molekylær biologi

• rec: bioperl-run

  Package not available

• rec: biosquid

  Redskaber for biologisk sekvensanalyse

• rec: cwltool

  Common Workflow Language - referenceimplementering

• rec: gffread

  GFF/GTF-formatkonverteringer, regionsfiltrering, FASTA-sekvensudtræk

• rec: goby-java

  Analyseværktøj for næstegenerations sekventeringsdata og -resultater

• rec: libace-perl

  Objektorienteret adgang til ACEDB-databaser

• rec: libai-fann-perl

  Perlomslag for FANN-biblioteket

• rec: libbambamc-dev

  Udviklingsfiler for læsning og skrivning af BAM-filer (arvemassejustering)

• rec: libbamtools-dev

  C++-API for manipulation af BAM-filer (genomsammenligning)

• rec: libbigwig-dev

  C-bibliotek til at håndtere bigWig-filer - teksthovedfiler

• rec: libbio-alignio-stockholm-perl

  Stockholm-sekvensstrøm for inddata/uddata

• rec: libbio-asn1-entrezgene-perl

  Fortolker for NCBI Entrez GENE- og NCBI SEquence-poster

• rec: libbio-chado-schema-perl

  DBIx::Class-lag for Chado-databaseskemaet

• rec: libbio-cluster-perl

  BioPerl-klyngemoduler

• rec: libbio-coordinate-perl

  BioPerl-moduler til arbejdet med biologiske koordinater

• rec: libbio-das-lite-perl

  Implementering af BioDas-protokollen

• rec: libbio-db-biofetch-perl

  Databaseobjektgrænseflade til BioFetch-indhentelse

• rec: libbio-db-embl-perl

  Databaseobjektgrænseflade til EMBL-indtastningsindhentelse

• rec: libbio-db-hts-perl

  Perlgrænseflade til HTS-biblioteket

• rec: libbio-db-ncbihelper-perl

  Samling af rutiner nyttige for forespørgsler til NCBI-databaser

• rec: libbio-db-seqfeature-perl

  Normalized feature for use with Bio::DB::SeqFeature::Store

• rec: libbio-eutilities-perl

  BioPerl-grænseflade til Entrez Programming Utilities - E-utilities

• rec: libbio-featureio-perl

  Moduler til at læse, skrive og manipulere sekvensfunktioner

• rec: libbio-graphics-perl

  Opret GD-aftryk af Bio::Seq-objekter

• rec: libbio-mage-perl

  Containermodul for klasser i MAGE-pakken: MAGE

• rec: libbio-mage-utils-perl

  Ekstra moduler for klasser i MAGE-pakken: MAGE

• rec: libbio-primerdesigner-perl

  Perlmodul til design af PCC-primere der bruger primer3 og epcr

• rec: libbio-samtools-perl

  Perlgrænseflade til SamTools-biblioteket for DNA-sekventering

• rec: libbio-scf-perl

  Perludvidelse til at læse og skrive SCF-sekvensfiler

• rec: libbio-tools-phylo-paml-perl

  Package not available

• rec: libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl

  Package not available

• rec: libbio-tools-run-alignment-tcoffee-perl

  Package not available

• rec: libbio-tools-run-remoteblast-perl

  Objekt for ekstern afvikling af NCBI Blast via HTTP

• rec: libbio-variation-perl

  BioPerl - variationsrelateret funktionalitet

• rec: libbiococoa-dev

  Package not available

• rec: libbiojava-java

  Java-API til biologiske data og programmer - standardversion

• rec: libbiojava4-java

  Java-API til biologiske data og programmer - standardversion
  also a virtual package provided by libbiojava4-java

• rec: libbiojava6-java

  Java API til biologiske data og programmer - version 6

• rec: libbioparser-dev

  Bibliotek til at fortolker flere formater i bioinformatik

• rec: libblasr-dev

  Værktøjer til at sammenligne PacBio-læsninger med målsekvenser - udviklingsfiler

• rec: libbpp-core-dev

  Bio++-basisbibliotek - udviklingsfiler

• rec: libbpp-phyl-dev

  Bio++ Phylogenetic-bibliotek - udviklingsfiler

• rec: libbpp-phyl-omics-dev

  Bio++-fylogenetikbibliotek: genomiske komponenter - udviklingsfiler

• rec: libbpp-popgen-dev

  Bio++-populationsgenetikbibliotek - udviklingsfiler

• rec: libbpp-qt-dev

  Bio++ Qt-grafik klassebibliotek - udviklingsfiler

• rec: libbpp-raa-dev

  Bio++-eksternt Acnus-adgangsbibliotek - udviklingsfiler

• rec: libbpp-seq-dev

  Bio++-sekvensbibliotek - udviklingsfiler

• rec: libbpp-seq-omics-dev

  Bio++-sekvensbibliotek: genomiske komponenter - udviklingsfiler

• rec: libcdk-java

  Chemistry Development Kit (CDK) - Javabiblioteker

• rec: libchado-perl

  Databaseskema og værktøjer for genomdata

• rec: libcifpp-dev

  Dokumentation for libcifpp

• rec: libconsensuscore-dev

  Algoritmer for PacBio multiple sequence consensus - udviklingsfiler

• rec: libdivsufsort-dev

  Teksthovedfiler for libdivsufsort

• rec: libedlib-dev

  Sekvenssammenligningsbibliotek der bruger edit distance - udvikling

• rec: libfast5-dev

  Bibliotek for læsning af Oxford Nanopore Fast5-filer - teksthoveder

• rec: libfastahack-dev

  Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - udvikling

• rec: libffindex0-dev

  Simpelt indeks/database for store mængder af små filer - udvikling

• rec: libfml-dev

  Udviklingsteksthoveder for libfml

• rec: libgatbcore-dev

  Udviklingsbibliotek for Genome Analysis Toolbox

• rec: libgclib-dev

  Teksthovedfiler for Genome Code Lib - GCLib

• rec: libgenome-dev

  Værktøjssæt til at udvikle bioinformatik-relaterede programmer - udvikling

• rec: libgenome-model-tools-music-perl

  Modul til at finde væsentlige mutationer i kræft

• rec: libgenome-perl

  Datakanaler, værktøjer og datahåndtering for genomik

• rec: libgenometools0-dev

  Udviklingsfiler for GenomeTools

• rec: libgff-dev

  GFF/GTF-fortolkning fra cufflinks som et bibliotek

• rec: libgkarrays-dev

  Bibliotek til at forespørge en stor samling af NGS-sekvenser - udvikling

• rec: libgo-perl

  Perlmoduler for Go og andre OBO-ontologier

• rec: libhdf5-dev

  HDF5 - udviklingsfiler - seriel version

• rec: libhmsbeagle-dev

  Højtydende bibliotek for bayesiansk og Maximum Likelihood-fylogeni - udvik.

• rec: libhts-dev

  Udviklingsfiler for HTSlib

• rec: libhtscodecs-dev

  Udviklingsteksthoveder for tilpasset kompression for CRAM og andre

• rec: libhtsjdk-java

  Java API for høj-gennemløbs sekventeringsdata (HTS) - formater

• rec: libjebl2-java

  Java Evolutionary Biology-bibliotek

• rec: libjloda-java

  Javabibliotek for datastrukturer og algoritmer for bioinformatik

• rec: libkmer-dev

  Værktøjspakke for DNA-sekvensanalyse - udviklingsbiblioteker

• rec: libmems-dev

  Udviklingsbibliotek til at understøtte DNA-strengmatchning og komparativ genomik

• rec: libminimap2-dev

  Udviklingsteksthoveder for libminimap

• rec: libmuscle-dev

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser - udviklingsbibliotek

• rec: libncbi-vdb-dev

  Biblioteker for brug af data i INSDC Sequence Read Archives - udvikling

• rec: libncbi6-dev

  NCBI-biblioteker for biologiprogrammer - udviklingsfiler

• rec: libncl-dev

  NEXUS-klassebibliotek - statisk bibliotek og teksthovedfiler

• rec: libngs-java

  Next Generation Sequencing-sprogbindinger - Javabindinger

• rec: libnhgri-blastall-perl

  Perludvidelse for afvikling og fortolkning af NCBI's BLAST 2.x

• rec: libopenmm-dev

  C++-teksthovedfiler for OpenMM-biblioteket

• rec: libopenms-dev

  Bibliotek for LC/MS-datahåndtering og analyse - udviklingsfiler

• rec: libpal-java

  Phylogenetic Analysis Library

• rec: libparasail-dev

  Udviklingsteksthoveder og statiske biblioteker for parasail

• rec: libpbbam-dev

  Pacific Biosciences binære sammenlignings-/oversættelsesbibliotek (BAM) - teksthoveder

• rec: libpbdata-dev

  Værktøjer til at håndtere PacBio-sekvenser - udviklingsfiler

• rec: libpbihdf-dev

  Værktøjer til at håndtere PacBio hdf5-filer - udvikingsfiler

• rec: libpbseq-dev

  Bibliotek til at håndtere PacBio-sekvenseringsdata - udviklingsfiler

• rec: libpdb-redo-dev

  Udviklingsfiler for libpdb-redo

• rec: libpll-dev

  Fylogenetisk sandsynlighedsbibliotek - udvikling

• rec: libpwiz-dev

  Package not available

• rec: libqes-dev

  DNA-sekvensfortolkningsbibliotek - udvikling

• rec: librcsb-core-wrapper0-dev

  Udviklingsfiler for librcsb-core-wrapper0t64

• rec: librdp-taxonomy-tree-java

  Bibliotek til taxonomitræ fra Ribosomal Database Projetct (RDP)

• rec: librg-blast-parser-perl

  Meget hurtig NCBI BLAST-fortolker - binding for Perl

• rec: librg-reprof-bundle-perl

  Proteinsekundær struktur- og tilgængelighedsprædiktor - Perlmodul

• rec: librostlab-blast0-dev

  Meget hurtigt C++-bibliotek til at fortolke resultatet af NCBI BLAST-programmer - udvikling

• rec: librostlab3-dev

  C++-bibliotek for beregningsbiologi - udvikling

• rec: libsbml5-dev

  System Biology Markup Language-bibliotek - udviklingsfiler

• rec: libseqan2-dev

  C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser - udvikling

• rec: libseqan3-dev

  C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser v3 - udvikling

• rec: libseqlib-dev

  C++ htslib/bwa-mem/fermi-grænseflade for interrogating sequence-data - udv.

• rec: libslow5-dev

  header and static library for reading & writing SLOW5 files

• rec: libsmithwaterman-dev

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - udvikling

• rec: libsnp-sites1-dev

  Statiske biblioteker og teksthovedfiler for pakken snp-sites

• rec: libsort-key-top-perl

  Perlmodul til at vælge og sortere top n elementer for en liste

• rec: libspoa-dev

  SIMD-sammenligningsværktøj for partial order - udviklingsfiler

• rec: libsrf-dev

  C++-implementering af SRF-formatet for DNA-sekvensdata

• rec: libssm-dev

  Makromolekylær superposition-bibliotek - udviklingsfiler

• rec: libssu-dev

  Højtydende fylogenetisk mangfoldighedsberegninger - udvikling

• rec: libssw-dev

  Udviklingsteksthoveder og statiske biblioteker for libssw
  also a virtual package provided by libssw-dev

• rec: libssw-java

  Javabindinger for libssw

• rec: libstaden-read-dev

  Udviklingsfiler for libstaden-read

• rec: libstatgen-dev

  Udviklingsfiler for libStatGen

• rec: libswiss-perl

  Perl-API til UniProt-databasen

• rec: libtabixpp-dev

  C++-omslag til tabix-indekseringsprogram - udviklingsfiler
  also a virtual package provided by libtabixpp-dev

• rec: libthread-pool-dev

  C++-trådpuljebibliotek kun med teksthoveder - udvikling

• rec: libvcflib-dev

  C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - udvikling

• rec: libvibrant6-dev

  NCBI-biblioteker for grafiske biologiprogrammer - udviklingsfiler

• rec: libwfa2-dev

  exact gap-affine algorithm (development)

• rec: libzerg-perl

  Hurtigt Perlmodul til at fortolke resultatet af NCBI BLAST-programmer

• rec: libzerg0-dev

  Udviklingsbiblioteker og teksthovedfiler for libzerg

• rec: mcl

  Markov Cluster-algoritmen

• rec: nim-hts-dev

  Package not available

• rec: nim-kexpr-dev

  Package not available

• rec: nim-lapper-dev

  Package not available

• rec: ont-fast5-api

  Simpel grænseflade til HDF5-filer for Oxford Nanopore .fast5-filformatet

• rec: pyfai

  Fast Azimuthal Integration-skripter

• rec: python3-airr

  Data Representation Standard-bibliotek for antibody- og TCR-sekvenser

• rec: python3-anndata

  Package not available

• rec: python3-bcbio-gff

  Python 3-bibliotek til at læse og skrive Generic Feature Format

• rec: python3-bioframe

  library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes

• rec: python3-biom-format

  Biological Observation Matrix-format (BIOM) - Python 3

• rec: python3-biomaj3

  BioMAJ-bibliotek til arbejdsforløb

• rec: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• rec: python3-biotools

  Python 3-bioinformatikredskaber for høj-gennemløb genomsekventering

• rec: python3-bx

  Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

• rec: python3-cgecore

  Python 3-modul for Center for Genomic Epidemiology

• rec: python3-cigar

  Manipuler SAM cigar-strenge

• rec: python3-cobra

  Begrænsningsbaseret modellering af biologiske netværk med Python 3

• rec: python3-cogent3

  Package not available

• rec: python3-cooler

  Bibliotek for et rumligt, komprimeret, binært vedvarende lager

• rec: python3-corepywrap

  Bibliotek der eksporterer C++-mmCIF-tilbehør til Python 3

• rec: python3-csb

  Pythonramme for strukturel bioinformatik - Python 3-version

• rec: python3-cutadapt

  Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb - Python 3

• rec: python3-cyvcf2

  VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3

• rec: python3-deeptools

  Platform til at udforske biologiske deep-sequencing-data

• rec: python3-deeptoolsintervals

  Håndtering af GTF-lignende sekvensassocieret interal-annotation

• rec: python3-dendropy

  DendroPy Phylogenetic Computing Library - Python 3

• rec: python3-dnaio

  Python 3-bibliotek for hurtig fortolkning af FASTQ- og FASTA-filer

• rec: python3-ete3

  Pythonmiljø for (fylogenetisk) træudforskning - Python 3.x

• rec: python3-fast5

  Bibliotek til at læse Oxford nanopore Fast 3-filer - Python 3

• rec: python3-freecontact

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Python 3

• rec: python3-gfapy

  Fleksibelt og udvideligt programbibliotek til at håndtere sekvensgrafer

• rec: python3-gffutils

  Arbejd med GFF- og GTF-filer i en fleksibel databaseramme

• rec: python3-gtfparse

  parser for gene transfer format (aka GFF2)

• rec: python3-htseq

  Python 3-redskaber til høj-gennemløb læseanalyse af genomsekventeringer

• rec: python3-intervaltree-bio

  Interval tree-praktiske klasser for genomiske data - Python 3-bibliotek

• rec: python3-kineticstools

  Registrering af DNA-ændringer - Python 3-bibliotek

• rec: python3-loompy

  Package not available

• rec: python3-mirtop

  Annoter miRNA'er med en mirna/isomir-navngivning - Python 3

• rec: python3-nanoget

  Udtræk information fra Oxford Nanopore-sekventeringsdata og sammenligninger

• rec: python3-ngs

  Next Generation Sequencing-sprogbindinger - Python 3-bindinger

• rec: python3-pairix

  1D/2D-indeksering og forespørgsler med et par af genomkoordinater

• rec: python3-pangolearn

  store of the trained model for pangolin to access

• rec: python3-parasail

  Python 3-bindinger for parasail C-biblioteket

• rec: python3-pbcommand

  Fælles kommandolinjegrænseflade for Pacific Biosciences-analysemoduler

• rec: python3-pbconsensuscore

  Algoritmer for PacBio multiple sequence consensus - Python 3

• rec: python3-pbcore

  Python 3-bibliotek til at behandle PacBio-datafiler

• rec: python3-peptidebuilder

  Opret atomisk oligopeptid 3D-struktur fra sekvens

• rec: python3-presto

  Værktøjssæt til at behandle B- og T-cellesekvenser - Python 3-modul

• rec: python3-propka

  Heuristiske pKa-beregninger med ligander - Python 3

• rec: python3-py2bit

  Adgang til 2bit-filer

• rec: python3-pyabpoa

  Adaptiv båndet Partial Order Alignment - Python 3-modul

• rec: python3-pyani

  Python 3-modul for gennemsnitlig nukleotid identitetanalyse

• rec: python3-pybedtools

  Python 3-omslag omkring BEDTools for bioinformatikarbejde

• rec: python3-pybel

  Biologisk udtrykssprog

• rec: python3-pybigwig

  Python 3-modul for hurtig adgang til bigBed- og bigWig-filer

• rec: python3-pyfaidx

  Effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python 3

• rec: python3-pyfastx

  Hurtig vilkårlig adgang til sekvenser fra FASTA/Q-fil - Python 3-modul

• rec: python3-pymummer

  Python 3-grænseflade til MUMmer

• rec: python3-pyranges

  2D-repræsentation af genom-intervaller og deres annotationer

• rec: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

• rec: python3-pyspoa

  Pythonbindinger for spoa

• rec: python3-pyvcf

  virtual package provided by python3-vcf

• rec: python3-rdkit

  Package not available

• rec: python3-ruffus

  Python 3-bibliotek til beregning af datakanaler brugt indenfor bioinformatik

• rec: python3-screed

  Korte nukleotide læsesekvensredskaber i Python 3

• rec: python3-shasta

  Nanopore-helgenomsamling - dynamisk bibliotek

• rec: python3-skbio

  Python3-datastrukturer, algoritmer, undervisningsressourcer for bioinformatik

• rec: python3-slow5

  Python3 modul for reading & writing SLOW5 files

• rec: python3-sqt

  SeQuencing-værktøjer for biologiske DNA/RNA-data med høj gennemløb

• rec: python3-streamz

  Byg datakanaler til at håndtere fortsættende datastrømme

• rec: python3-tinyalign

  Numerisk repræsentation af forskelle mellem strenge

• rec: python3-torch

  Package not available

• rec: python3-treetime

  Inferens af tidsstemplede fylogenier og forfædres rekonstruktion - Python 3

• rec: python3-unifrac

  Højtydende fylogenetisk mangfoldighedsberegninger

• rec: python3-wdlparse

  Workflow Description Language-fortolker (WDL) for Python

• rec: r-bioc-biobase

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• rec: r-cran-boolnet

  Samling, analyse og visualisering af booleske netværk

• rec: r-cran-corrplot

  Visualisering af en korrelationsmatrix

• rec: r-cran-distory

  GNU R-afstand mellem fylogenetiske historier

• rec: r-cran-fitdistrplus

  Understøtter tilpasning af parametrisk distribution

• rec: r-cran-forecast

  GNU R-prognosefunktioner for tidsserier og lineære modeller

• rec: r-cran-genetics

  GNU R-pakke for befolkningsgenetik

• rec: r-cran-gprofiler2

  Interface to the 'g:Profiler' Toolset

• rec: r-cran-haplo.stats

  GNU R-pakke for haplotype-analyse

• rec: r-cran-metamix

  Package not available

• rec: r-cran-phangorn

  GNU R-pakke for fylogenetisk analyse

• rec: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• rec: r-cran-phylobase

  GNUR-grundpakke for fylogenetiske strukturer og komparative data

• rec: r-cran-pscbs

  R-pakke - analyse af overordnede og specifikke DNA-kopinumre

• rec: r-cran-qqman

  R-pakke til at visualisere GWAS-resultater via Q-Q- og Manhattan-plot

• rec: r-cran-rentrez

  GNU R-grænseflade til NCBI's EUtils API

• rec: r-cran-rncl

  GNU R-grænseflade til Nexus Class-biblioteket

• rec: r-cran-rnexml

  GNU R-pakke til semantisk at berige I/O for formatet »NeXML«

• rec: r-cran-rotl

  GNU R-grænseflade til »Open Tree of Life«-API'en

• rec: r-cran-samr

  GNU R-signifikansanalyse af mikrotabeller

• rec: r-cran-sctransform

  Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI-data

• rec: r-cran-seqinr

  GNU R-biologiske sekvenser - indhentelse og analyse

• rec: r-cran-seurat

  Package not available

• rec: r-cran-tsne

  T-distribueret stokastisk naboindlejring for R (t-SNE)

• rec: r-cran-vegan

  Fællesskabsøkologi for R

• rec: r-cran-webgestaltr

  Find overrepræsenterede egenskaber i gen-lister

• rec: ruby-bio

  Ruby-værktøjer til beregningsmolekylær biologi

• rec: ruby-crb-blast

  Kør betinget gensidig bedste BLAST

• rec: sbmltoolbox

  Libsbml - værktøjsboks for octave og matlab

• rec: snakemake

  Pythonisk system for håndtering af arbejdsforløb

• rec: toil

  Package not available

• sug: bioclipse

  Package not available

• sug: capsule-nextflow

  Paknings- og udrulningsværktøj for Javaprogrammer

• sug: conda-package-handling

  Opret og udtræk conda-pakker i diverse formater

• sug: ctdconverter

  Konverter CTD-filer til Galaxy-værktøj og CWL CommandLIneTool-filer

• sug: cthreadpool-dev

  Minimal ANSI C-trådkø - udviklingsfiler

• sug: cwlformat

  Formateringsprogram til kode for Commone Workflow Language

• sug: libargs-dev

  Simpelt C++-argumentfortolkerbibliotek kun med teksthoveder

• sug: libatomicqueue-dev

  Package not available

• sug: libbam-dev

  Manipulerer nukleotide sekvenssammenligninger i BAM- eller SAM-format

• sug: libbbhash-dev

  Bloom-filter-baseret minimal perfect hash-funktionsbibliotek

• sug: libbiosoup-dev

  C++-understøttelsesbibliotek kun med teksthoved for bioinformatics-værktøjer

• sug: libbtllib-dev

  Bioinformatics Technology Lab - bibliotek for fælles kode

• sug: libcapsule-maven-nextflow-java

  packaging tool for Java applications with Maven coordinates

• sug: libconcurrentqueue-dev

  Låsefri kø for C++ i industrikvalitet

• sug: libdisorder-dev

  Bibliotek til entropimåling af bytestrømme - udvikling

• sug: libfast-perl

  Package not available

• sug: libforester-java

  Package not available

• sug: libfreecontact-dev

  Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler
  also a virtual package provided by libfreecontact-dev

• sug: libfreecontact-doc

  Dokumentation for libfreecontact

• sug: libfreecontact-perl

  Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Perl

• sug: libgatk-bwamem-java

  interface to call Heng Li's bwa mem aligner from Java code

• sug: libgatk-bwamem-jni

  interface to call Heng Li's bwa mem aligner from Java code (jni)

• sug: libgatk-fermilite-java

  interface to call Heng Li's fermi-lite assembler from Java code

• sug: libgatk-fermilite-jni

  interface to call Heng Li's fermi-lite assembler from Java code (jni)

• sug: libgatk-native-bindings-java

  Bibliotek med standardbindinger for gatk og picard-tools

• sug: libgenomicsdb-dev

  Package not available

• sug: libgenomicsdb-java

  Package not available

• sug: libicb-utils-java

  Java library of utilities to manage files and compute statistics

• sug: libmaus2-dev

  Samling af datastrukturer og algoritmer for biobambam - udvikling

• sug: libmilib-java

  Bibliotek for Next Generation Sequencing-databehandling (NGS)

• sug: libminimap-dev

  Udviklingsteksthoveder for libminimap

• sug: libmmblib-dev

  Package not available

• sug: libmodhmm-dev

  Bibliotek til at konstruere, træne og bedømme skjulte Markov-modeller - udvikling

• sug: libnexml-java

  Package not available

• sug: libngs-sdk-dev

  Package not available

• sug: libpbcopper-dev

  Datastrukturer, algoritmer og redskaber for C++-programmer - teksthovedfiler

• sug: libqcpp-dev

  Package not available

• sug: librelion-dev

  Package not available

• sug: libroadrunner-dev

  Package not available

• sug: librostlab-blast-doc

  Meget hurtigt C++-bibliotek til at fortolke resultatet af NCBI BLAST-programmer - dok.

• sug: librostlab-doc

  C++-bibliotek for beregningsbiologi - dokumentation

• sug: libsavvy-dev

  C++-grænseflade for SAV-filformatet

• sug: libsuma-dev

  Package not available

• sug: libsvmloc-dev

  PSORTb-tilpasset bibliotek for svm-maskinlæringsbiblioteket - udvikling

• sug: libswarm2-dev

  Package not available

• sug: libterraces-dev

  enumerate terraces in phylogenetic tree space (development lib)

• sug: libtfbs-perl

  Skanning af en DNA-sekvens med en positionsvægtet matrix

• sug: libvbz-hdf-plugin-dev

  VBZ compression plugin for nanopore signal data (devel)

• sug: libxxsds-dynamic-dev

  Succinct og komprimerede fuldt dynamiske datastrukturer - bibliotek

• sug: octace-bioinfo

  Package not available

• sug: python-biopython-doc

  Dokumentation for biblioteket Biopython

• sug: python3-alignlib

  Edit- og Hamming-afstande for biologiske sekvenser

• sug: python3-bcbio

  Package not available

• sug: python3-bel-resources

  Python 3-redskaber for BEL-ressourcefiler

• sug: python3-bioblend

  CloudMan and Galaxy API library (Python 3)

• sug: python3-biopython-sql

  Biopython-understøttelse for BioSQL-databaseskemaet - Python 3

• sug: python3-cgelib

  Python 3-kode til udnyttelse på tværs af CGE-værktøjer

• sug: python3-compclust

  Package not available

• sug: python3-conda-package-streaming

  Hent conda-metadata

• sug: python3-consensuscore2

  Package not available

• sug: python3-ctdopts

  Giver dine Pythonværktøjer en CTD-kompatibel grænseflade

• sug: python3-galaxy-lib

  Package not available

• sug: python3-intake

  Package not available

• sug: python3-joypy

  Ridgeline-/joyplot-plotrutine

• sug: python3-misopy

  Package not available

• sug: python3-ncls

  Datastruktur for forespørgsler for intervaloverlap

• sug: python3-networkx

  Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk - Python 3

• sug: python3-pycosat

  Pythonbindinger til picosat

• sug: python3-pyflow

  Package not available

• sug: python3-roadrunner

  Package not available

• sug: python3-scanpy

  Package not available

• sug: python3-seqcluster

  analysis of small RNA in NGS data

• sug: q2-alignment

  Package not available

• sug: q2-composition

  Package not available

• sug: q2-cutadapt

  Package not available

• sug: q2-dada2

  Package not available

• sug: q2-deblur

  Package not available

• sug: q2-demux

  Package not available

• sug: q2-diversity

  Package not available

• sug: q2-emperor

  Package not available

• sug: q2-feature-classifier

  Package not available

• sug: q2-feature-table

  Package not available

• sug: q2-fragment-insertion

  Package not available

• sug: q2-gneiss

  Package not available

• sug: q2-longitudinal

  Package not available

• sug: q2-metadata

  Package not available

• sug: q2-phylogeny

  Package not available

• sug: q2-quality-control

  Package not available

• sug: q2-quality-filter

  Package not available

• sug: q2-sample-classifier

  Package not available

• sug: q2-shogun

  Package not available

• sug: q2-taxa

  Package not available

• sug: q2-types

  Package not available

• sug: q2-vsearch

  Package not available

• sug: q2cli

  Package not available

• sug: q2cwl

  Package not available

• sug: q2lint

  Package not available

• sug: q2templates

  Designskabelonpakke for QIIME 2-udvidelsesmoduler

• sug: qiime

  Package not available

• sug: r-bioc-affxparser

  Affymetrix File Parsing SDK

• sug: r-bioc-affy

  BioConductor-metoder for Affymetrix Oligonucleotide Arrays

• sug: r-bioc-affyio

  BioConductor-værktøjer for fortolkning af Affymetrix-datafiler

• sug: r-bioc-altcdfenvs

  BioConductor - alternative CDF-miljøer

• sug: r-bioc-annotate

  BioConductor-annotation for microarray'er

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• sug: r-bioc-annotationhub

  GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

• sug: r-bioc-aroma.light

  BioConductor-metoder - normalisering og visualisering af microarray-data

• sug: r-bioc-arrayexpress

  Adgang til ArrayExpress Microarray Database på EBI

• sug: r-bioc-biocgenerics

  Generiske funktioner for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocneighbors

  Nearest Neighbor Detection for Bioconductor-pakker

• sug: r-bioc-biomart

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• sug: r-bioc-biomformat

  GNU R-grænsefladepakke for filformatet BIOM

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• sug: r-bioc-biovizbase

  GNU R-grundlæggende grafiske redskaber for visualsiering af genomiske data

• sug: r-bioc-bitseq

  Package not available

• sug: r-bioc-bridgedbr

  Package not available

• sug: r-bioc-bsgenome

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-cager

  Package not available

• sug: r-bioc-cner

  CNE-registrering og visualisering

• sug: r-bioc-complexheatmap

  Lav komplekse varmekort via GNU R

• sug: r-bioc-ctc

  Klynge- og trækonvertering

• sug: r-bioc-cummerbund

  Værktøjer for analyse af Cufflinks RNA-Seq-uddata

• sug: r-bioc-dada2

  Prøveslutning fra amplicon-sekventeringsdata

• sug: r-bioc-deseq

  GNU R-differential genudtryksanalyse

• sug: r-bioc-deseq2

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-dnacopy

  R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer

• sug: r-bioc-ebseq

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-enrichedheatmap

  Package not available

• sug: r-bioc-ensembldb

  GNU R-redskaber til at oprette og bruge en Ensembl-baseret annotationsdatabase

• sug: r-bioc-genefilter

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• sug: r-bioc-geneplotter

  R-pakke med funktioner til plot af genomdata

• sug: r-bioc-genomeinfodb

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• sug: r-bioc-genomicalignments

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• sug: r-bioc-geoquery

  Hent data fra NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)

• sug: r-bioc-go.db

  Annotationskort der beskriver hele genontologien

• sug: r-bioc-graph

  Håndtere grafdatastrukturer for BioConductor

• sug: r-bioc-gseabase

  Gene Set Enrichment Analysis - datastrukturer og metoder

• sug: r-bioc-gsva

  Gene Set Variation Analysis for microarray og RNA-seq-data

• sug: r-bioc-gviz

  Plot data og annotationsinformation langs genomiske koordinater

• sug: r-bioc-hypergraph

  BioConductor - hypergraf-datastrukturer

• sug: r-bioc-impute

  Imputering for microarray-data

• sug: r-bioc-iranges

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• sug: r-bioc-limma

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-bioc-makecdfenv

  BioConductor CDF Environment Maker

• sug: r-bioc-mergeomics

  Integrerende netværksanalyse af omics-data

• sug: r-bioc-metagenomeseq

  GNU R-statistisk analyse for tynd høj-gennemløb sekventering

• sug: r-bioc-mofa

  Multi-Omics Factor Analysis (MOFA)

• sug: r-bioc-multiassayexperiment

  Program for integration af multi-omics-eksperimenter i BioConductor

• sug: r-bioc-nanostringqcpro

  Package not available

• sug: r-bioc-oligo

  Forbrænderværktøjer for oligonukleotid tabeller

• sug: r-bioc-oligoclasses

  Klasser for høj-gennemløbs tabeller understøttet af oligo og crlmm

• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

  Genom-bred annotation for mennesker

• sug: r-bioc-pcamethods

  BioConductor-samling af PCA-metoder

• sug: r-bioc-phyloseq

  GNU R-håndtering og analyse af høj-gennemløb microbiome censusdata

• sug: r-bioc-preprocesscore

  BioConductor - samling af forbrænderfunktioner

• sug: r-bioc-purecn

  Kopier nummerkald og SNV-klassifikation via målrettet kort læsningssekventering

• sug: r-bioc-qusage

  Qusage - kvantitativ sætanalyse til genekspression

• sug: r-bioc-rbgl

  R-grænseflade til grafalgoritmerne indeholdt i BOOST-biblioteket

• sug: r-bioc-rentrez

  Package not available

• sug: r-bioc-rsamtools

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• sug: r-bioc-rtracklayer

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• sug: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• sug: r-bioc-savr

  GNU R - fortolk og analyser Illumina SAV-filer

• sug: r-bioc-shortread

  GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

• sug: r-bioc-snpstats

  BioCondutor - SnpMatrix- og XSnpMatrix-klasser og metoder

• sug: r-bioc-structuralvariantannotation

  Variantannotationer for strukturelle varianter

• sug: r-bioc-tfbstools

  GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis

• sug: r-bioc-titancna

  Subklonalt kopiantal og LOH-forudsigelse fra helgenomsekventering

• sug: r-bioc-tximport

  Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering

• sug: r-bioc-variantannotation

  BioConductor-annotation af genetiske varianter

• sug: r-bioc-xvector

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• sug: r-cran-adegenet

  GNU R-undersøgende analyse af genetisk og genomdata

• sug: r-cran-adephylo

  GNU R-sonderende analyser for den fylogenetiske kompatrative metode

• sug: r-cran-amap

  Endnu en flerdiminsionel analysepakke

• sug: r-cran-biwt

  Biweight middelvektor og kovarians og korrelation

• sug: r-cran-drinsight

  Package not available

• sug: r-cran-dt

  GNU R-omslag for JavaScript-bibliotkeet »DataTables«

• sug: r-cran-dynamictreecut

  Metoder til registrering af klynger i Hierarchical Clustering

• sug: r-cran-fastcluster

  Hurtige hierarkiske klyngerutiner for GNU R

• sug: r-cran-future.apply

  Anvend funktioner på elementer parallelt via futures

• sug: r-cran-future.batchtools

  Fremtidig API for parallel og distribueret behandling

• sug: r-cran-ica

  Uafhængig komponentanalyse

• sug: r-cran-itertools

  Iterator-værktøjer

• sug: r-cran-kaos

  Kodning af sekvenser baseret på Frequency Matrix Chaos

• sug: r-cran-metap

  Metaanalyse af signifikansværdier

• sug: r-cran-minerva

  Maximal Information-Based Nonparametric Exploration

• sug: r-cran-natserv

  GNU R »NatureServe«-grænseflade

• sug: r-cran-nmf

  GNU R-ramme til at udføre ikke negativ matrix-faktorering

• sug: r-cran-optimalcutpoints

  Beregning af optimale klippepunkter i diagnostiske test

• sug: r-cran-parmigene

  Parallel Mutual Information til at etablere gennetværk

• sug: r-cran-pcapp

  Robust PCA af Projection Pursuit

• sug: r-cran-proc

  Vis og analyser ROC-kurver

• sug: r-cran-rann

  Fast Nearest Neighbour Search via L2-måling

• sug: r-cran-rcpphnsw

  R-bindinger for et bibliotek for Approximate Nearest Neighbors

• sug: r-cran-robustrankaggreg

  Metoder for robust bedømmelsessammenlægning

• sug: r-cran-rocr

  GNU R-pakke til at forberede og vise ROC-kurver

• sug: r-cran-rook

  Internetservergrænseflade for R

• sug: r-cran-rsvd

  Randomiseret singular værdidekomponering

• sug: r-cran-shazam

  Immunoglobulin somatisk hypermutationsanalyse

• sug: r-cran-sitmo

  GNU R-parallel pseudo-vilkårlig talopretter »sitmo« - teksthovedfiler

• sug: r-cran-venndiagram

  Opret højopløsnings Venn- og Euler-plot

• sug: r-other-apmswapp

  Package not available

• sug: ruby-rgfa

  Fortolk, rediger og skriv grafer i GFA-formatet i Ruby

• sug: vdjtools

  framework for post-analysis of B/T cell repertoires

Download med-bio-dev

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	11.3 kB	33.0 kB	[list of files]