Package: r-bioc-oligo (1.68.2+ds-1)

[ Source: r-bioc-oligo  ]

Forbrænderværktøjer for oligonukleotid tabeller

En pakke til at analyse oligonukleotid tabeller (expression/SNP/tiling/exon) på prøveniveau. Det understøtter i øjeblikket Affymetrix (CEL-filer) og NimbleGen-tabeller (XYS-filer).

Other Packages Related to r-bioc-oligo

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.76.0)

  Affymetrix File Parsing SDK

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.74.0)

  BioConductor-værktøjer for fortolkning af Affymetrix-datafiler

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.66.0)

  Klasser for høj-gennemløbs tabeller understøttet af oligo og crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.66.0)

  BioConductor - samling af forbrænderfunktioner

• dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  GNU R-pakke der tilbyder en generisk databasegrænseflade

• dep: r-cran-ff

  Hukommelseseffektiv lagt med hurtig adgang for store datamængder

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R-driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biomart (>= 2.60.1)

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0)

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• sug: r-bioc-limma (>= 3.60.3)

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-oligo

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	898.9 kB	1,344.0 kB	[list of files]