[ ソース: r-bioc-oligo ]
パッケージ: r-bioc-oligo (1.68.2+ds-1)
r-bioc-oligo に関するリンク
Debian の資源:
r-bioc-oligo ソースパッケージをダウンロード:
- [r-bioc-oligo_1.68.2+ds-1.dsc]
- [r-bioc-oligo_1.68.2+ds.orig.tar.xz]
- [r-bioc-oligo_1.68.2+ds-1.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [bioconductor.org]
類似のパッケージ:
Preprocessing tools for oligonucleotide arrays
A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).
その他の r-bioc-oligo 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: r-api-4.0
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.19
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-affxparser (>= 1.76.0)
- Affymetrix File Parsing SDK
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- dep: r-bioc-affyio (>= 1.74.0)
- BioConductor tools for parsing Affymetrix data files
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- dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)
- base functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.66.0)
- Classes for high-throughput arrays supported by oligo and crlmm
-
- dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.66.0)
- BioConductor collection of pre-processing functions
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- dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
-
- dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)
- GNU R package providing a generic database interface
-
- dep: r-cran-ff
- Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data
-
- dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)
- Database Interface R driver for SQLite
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- sug: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)
- GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
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- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-biomart (>= 2.60.1)
- GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)
-
- sug: r-bioc-genefilter (>= 1.86.0)
- methods for filtering genes from microarray experiments
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- sug: r-bioc-limma (>= 3.60.3)
- linear models for microarray data
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-rcolorbrewer
- GNU R package providing suitable color palettes
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- sug: r-cran-rcurl
- GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
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- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework