Package: srst2 (0.2.0-12) [debports]

[ Source:  ]

Kort læsesekvensindtastning for bakterielle patogener

Dette program er designet til at bruge Illumina-sekvensdata, en MLST-database og/eller en database med gensekvenser (f.eks. resistente gener, virulensgener etc.) og rapportere tilstedeværelsen af ST'er og/eller referencegener.

Other Packages Related to srst2

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: cd-hit

  Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• dep: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: python3-rpy2

  Python 3-grænseflade til GNU R-sproget og miljøet - version 2

Download srst2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sh4 (unofficial port)	59.8 kB	265.0 kB	[list of files]