Package: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 and others)

[ Source: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci-oversætter (QTL) i cis for molekylære fænotyper

Formålet med FastQTL er at identificere enkelt-nucleotid polymorfismer (SNP'er), der er signifikant forbundet med forskellige molekylære fænotyper (dvs. ekspression af kendte gener, cytosin methylering-niveauer osv). Det udfører skanninger efter alle mulige fænotype-variantpar i cis (dvs. varianter beliggende inden for en bestemt vindue omkring en fænotype). FastQTL implementerer en ny permutationsordning (Beta-tilnærmelse) til præcist og hurtigt at korrigere for multiple-test både på niveauerne for genotypen og fænotypen.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to fastqtl

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Bibliotek for Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  bibliotek til programindstillinger for C++

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) - bibliotekspakke

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: r-mathlib (>= 4.4.1)

  GNU R - uafhængigt matematikbibliotek

• rec: r-cran-argparser

  GNU R-kommandolinjeargumentfortolker

• rec: r-cran-qvalue

  Package not available

• rec: r-cran-tools

  Package not available

• sug: fastqtl-doc

  QTL-oversætter i cis for molekylære fænotyper - dokumentation

Download fastqtl

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b3	219.1 kB	758.0 kB	[list of files]