Пакет: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 и другие)

[ Источник: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Пользовательский интерфейс: interface::commandline, role::program, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к fastqtl

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  библиотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

• dep: r-mathlib (>= 4.4.1)

  GNU R standalone mathematics library

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Пакет недоступен

• rec: r-cran-tools

  Пакет недоступен

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Загрузка fastqtl

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b3	219,1 Кб	758,0 Кб	[список файлов]