Package: python3-bx (0.13.0-1 and others)

[ Source: python-bx  ]

Bibliotek til at håndtere genomiske data og deres sammenligning

Projektet bx-python er et Python 3-bibliotek og associeret sæt af skripter til at tillade hurtig implementering af analyser på genomskala. Biblioteket indeholder en række nyttige moduler, men de specifikke styrker er:

 * Klasser til at læse og arbejde med genom-scale multiple local-
   sammenligninger (i MAF-, AXT- og LAV-formater)
 * Generisk datastruktur for indeksering af diskfiler, der indeholder
   datablokke associeret med intervaller på diverse sekvenser (brugt, for
   eksempel, til at tilbyde vilkårlig adgang til individuelle
   sammenligninger i store filer; optimeret for brug over
   netværksfilsystemer
 * Datastrukturer for arbejdet med intervaller på sekvenser
 * »Binned bitsets« der fungerer ligesom bit-tabeller i kromosomstørrelse,
   men dovent allokerer regioner og tillader store blokke for alle sæt
   eller alle ikke satte bit for kompakt lagring
 * »Intersecter« for udførelse af hurtig intersektionstest, der bevarer
   både forespørgsel og målintervaller og associeret annotation

Other Packages Related to python3-bx

• dep: libc6 (>= 2.11) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [not ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [not ia64]

• dep: python3-lzo

  Pythonbindinger for LZO-datakompressionsbiblioteket - Python 3

• dep: python3-numpy [not ia64]

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [not ia64]

  virtual package provided by python3-numpy

  or python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-pyparsing [not ia64]

  Alternativ til at oprette og køre simple grammatikker - Python 3.x

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download python3-bx

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	0.13.0-1+b3	640.5 kB	4,211.0 kB	[list of files]
amd64	0.13.0-1+b3	695.1 kB	3,485.0 kB	[list of files]
arm64	0.13.0-1+b3	630.0 kB	3,800.0 kB	[list of files]
armel	0.13.0-1+b3	612.6 kB	3,757.0 kB	[list of files]
armhf	0.13.0-1+b3	633.2 kB	3,309.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	0.13.0-1+b3	638.8 kB	3,362.0 kB	[list of files]
i386	0.13.0-1+b3	686.2 kB	3,545.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	0.11.0-4	1,140.4 kB	9,842.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	0.13.0-1+b3	682.6 kB	4,182.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	0.13.0-1+b3	581.0 kB	3,004.0 kB	[list of files]
mips64el	0.13.0-1+b3	583.1 kB	3,962.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	0.13.0-1+b3	665.2 kB	4,632.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.13.0-1+b3	673.1 kB	4,439.0 kB	[list of files]
riscv64	0.13.0-1+b3	707.3 kB	2,964.0 kB	[list of files]
s390x	0.13.0-1+b3	656.5 kB	3,439.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	0.13.0-1+b3	739.6 kB	3,441.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	0.13.0-1+b3	575.6 kB	23,709.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	0.13.0-1+b3	704.7 kB	3,305.0 kB	[list of files]