Pacote: python3-bx (0.13.0-1 e outros)

[ Fonte: python-bx  ]

library to manage genomic data and its alignment

The bx-python project is a Python3 library and associated set of scripts to allow for rapid implementation of genome scale analyses. The library contains a variety of useful modules, but the particular strengths are:

 * Classes for reading and working with genome-scale multiple local
   alignments (in MAF, AXT, and LAV formats)
 * Generic data structure for indexing on disk files that contain blocks of
   data associated with intervals on various sequences (used, for example, to
   provide random access to individual alignments in huge files; optimized
   for use over network filesystems)
 * Data structures for working with intervals on sequences
 * "Binned bitsets" which act just like chromosome sized bit arrays, but
   lazily allocate regions and allow large blocks of all set or all unset
   bits to be stored compactly
 * "Intersecter" for performing fast intersection tests that preserve both
   query and target intervals and associated annotation

Outros pacotes relacionados a python3-bx

• dep: libc6 (>= 2.11) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [não ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [não ia64]

• dep: python3-lzo

  Python bindings for the LZO data compression library (Python 3)

• dep: python3-numpy [não ia64]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  pacote virtual fornecido por python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [não ia64]

  pacote virtual fornecido por python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  pacote virtual fornecido por python3-numpy

• dep: python3-pyparsing [não ia64]

  alternativa para criar e executar gramáticas simples - Python 3.x

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de python3-bx

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	640.5 kB	4,211.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.13.0-1+b3	695.1 kB	3,485.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.13.0-1+b3	630.0 kB	3,800.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.13.0-1+b3	612.6 kB	3,757.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.13.0-1+b3	633.2 kB	3,309.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	638.8 kB	3,362.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.13.0-1+b3	686.2 kB	3,545.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.11.0-4	1,140.4 kB	9,842.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	682.6 kB	4,182.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	581.0 kB	3,004.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.13.0-1+b3	583.1 kB	3,962.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	665.2 kB	4,632.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.13.0-1+b3	673.1 kB	4,439.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.13.0-1+b3	707.3 kB	2,964.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.13.0-1+b3	656.5 kB	3,439.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	739.6 kB	3,441.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	575.6 kB	23,709.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.13.0-1+b3	704.7 kB	3,305.0 kB	[lista de arquivos]