Package: r-bioc-shortread (1.62.0-1) [debports]

[ Source:  ]

GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

Dette BioConductor-modul er en pakke for inddata, kvalitetsvurdering, manipulering og uddata for høj-gennemløb sekventeringsdata. ShortRead tilbydes i R- og BioConductor-miljøerne, hvilket giver klar adgang til yderligere faciliteter for avanceret statistisk analyse, datatransformation, visualisering og integration med diverse genomressourcer.

Other Packages Related to r-bioc-shortread

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)

  Grundlæggende funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0)

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-pwalign (>= 1.0.0-2~0exp1)

  Perform pairwise sequence alignments

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 3.0.0)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-hwriter

  HTML Writer - R-objekter i HTML-format

• dep: r-cran-lattice

  GNU R-pakke for »Trellis«-grafik

• dep: r-cran-latticeextra

  GNU R-pakke for yderligere grafiske visninger baseret på lattice

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biomart (>= 2.60.1)

  GNU R Interface til BioMart-databsaer (Ensembl, COSMIC, Wormbase og Gramene)

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-shortread

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64 (unofficial port)	5,099.6 kB	8,320.0 kB	[list of files]