Package: python3-cyvcf2 (0.31.1-2) [debports]

[ Source:  ]

VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3

Dette modul tillader hurtig fortolkning af VCF og BCF inklusive regionsforespørgsler med Python. Dette er essentielt for effektiv analyse af nukleotid variation med Python på sekventeringsdata med høj-gennemløb.

Cyvcf2 er et cython-omslag omkring htslib. Attributter som variant.gt_ref_depths returnerer en numpy-tabel direkte, så de er direkte klar til brug.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Other Packages Related to python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-click

  Oprettelsessæt for kommandolinjegrænsefladen - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  Farvelagt terminal for Python 3's logningsmodul

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

Download python3-cyvcf2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64 (unofficial port)	864.3 kB	5,728.0 kB	[list of files]