all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source:  ]

Package: libfreecontact-dev (1.0.21-14) [debports]

Links for libfreecontact-dev

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder filer nødvendige for udvikling af programmer med libfreecontact.

Packages providing libfreecontact-dev

libfreecontact-dev
Hurtig protein-kontaktprædiktorbibliotek - udviklingsfiler

Other Packages Related to libfreecontact-dev

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download libfreecontact-dev

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
ppc64 (unofficial port) 85.9 kB351.0 kB [list of files]