Package: clustalw (2.1+lgpl-7)

[ Source: clustalw  ]

Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

Dette program udfører en sammenligning af flere nukleotid- eller aminosyresekvenser. Det genkender formatet for inddatasekvenser, og om sekvenser er nukleinsyre (DNA / RNA) eller aminosyre (proteiner). Uddataformatet kan vælges i forskellige formater for flere sammenligninger såsom Phylip eller FASTA. Clustal W er velaccepteret.

Produktionen af ​​Clustal W kan redigeres manuelt, men helst med et justeringssredigeringsprogram som SeaView eller indenfor dens følgesvend Clustal X. Når man bygger en model fra din sammenligning, kan denne anvendes til forbedrede databasesøgninger. Debianpakken HMMER skaber en sådan i form af en HMM.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, User Interface: Text-based Interactive, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Comparing, Supports Format: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Other Packages Related to clustalw

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• sug: clustalx

  Flere sammenligninger af nukledie syre- og proteinsekvenser - grafisk brugerflade

• sug: seaview

  Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni

• enh: bioperl-run

  BioPerl-omslag: skripter

• enh: emboss

  Programpakke til europæisk molekylærbiologi

• enh: t-coffee

  Flersekvensjustering

Download clustalw

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
mips64el	259.1 kB	941.0 kB	[list of files]