Package: cd-hit (4.8.1-4)

[ Source: cd-hit  ]

Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser

Cd-hit indeholder et antal programmer designet til hurtigt at gruppere sekvenser. Cd-hit grupperer proteiner i klynger, som når en brugerdefineret lighedstærskel. Cd-hit-est svarer til cd-hit, men er designet til at gruppere nukleotidsekvenser (uden introner). Cd-hit-est-2d ligner cd-hit-2d men er designet til at sammenligne to nukleotide datasæt. Et antal andre relaterede programmer er også inkluderet i pakken. Se venligst manualen for cd-hit, også en del af denne pakke, for yderligere information.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: perl

  Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download cd-hit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	511.4 kB	1,477.0 kB	[list of files]