Pakiet: cd-hit (4.8.1-4)

[ Pakiet źródłowy: cd-hit  ]

Pakiet programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji

Pakiet cd-hit zawiera szereg programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji. cd-hit grupuje białka w klastry, które spełniają zdefiniowany przez użytkownika próg podobieństwa. cd-hit-est jest podobny do cd-hit, ale przeznaczony do grupowania sekwencji nukleotydowych (bez intronów). cd-hit-est-2d jest podobny do cd-hit-2d, ale przeznaczony do porównywania dwóch zestawów danych nukleotydów. W tym pakiecie znajduje się również wiele innych powiązanych programów. Więcej informacji można znaleźć w podręczniku użytkownika cd-hit, który również jest częścią tego pakietu.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, use::comparing, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.7)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie cd-hit

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	511,4 KiB	1 477,0 KiB	[lista plików]