all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: samblaster  ]

Package: samblaster (0.1.26-4)

Links for samblaster

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package samblaster:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger

Nuværende »next-generation« sekventeringsteknologi kan ikke fortælle hvilken præcis sekvens de vil læse. De tager hvad der er tilgængelig. Og hvis nogle sekvenser læses meget ofte, så skal dette bruge lidt ekstra biomedicinsk tænkning. Genomet kan for eksempel blive duplikeret.

Samblaster er et hurtigt og fleksibelt program til at markere dubletter i read-id-grupperede paired-end SAM-filer. Det kan også valgfrit fremstille discordant read pairs og/eller opdele læsningsoversættelser til separate SAM-filer, og/eller unmapped/clipped læsninger til en separat FASTQ-fil. Når dubletter markeres vil samblaster kræver cirka 20 MB hukommelse per 1M læste par.

Other Packages Related to samblaster

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download samblaster

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
armel 22.8 kB85.0 kB [list of files]