wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: samblaster  ]

Pakiet: samblaster (0.1.26-4)

Odnośniki dla samblaster

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego samblaster:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

marks duplicates, extracts discordant/split reads

Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.

samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.

Inne pakiety związane z samblaster

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie samblaster

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
armel 22,8 KiB85,0 KiB [lista plików]