all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source:  ]

Package: mash (2.3+dfsg-6 and others) [debports]

Links for mash

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtig genom- og metagenomafstandsestimering via MinHash

Mash bruger MinHash lokalitetssensitiv hashing til at reducere store biosekvenser til en repræsentativ kladde og hurtigt estimere parvise afstande mellem genomer eller metagenomer. Mash tegner databaser effektivt afgrænset kendt artsgrænser, tillader konstruktion af omtrentlige fylogenier og kan være søgt på sekunder ved hjælp af samlede genomer eller rå sekventeringskørsler fra Illumina, Pacific Biosciences og Oxford Nanopore. Ved metagenomik skalerer Mash sig til tusinder af prøver og kan replikere Human Microbiome Project- og Global Ocean Survey-resultater i en brøkdel af tiden.

Other Packages Related to mash

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download mash

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
alpha (unofficial port) 2.3+dfsg-6+b1 176.8 kB620.0 kB [list of files]