Package: libgenomicsdb1 (1.5.3-3 and others) [debports]

[ Source:  ]

Rumligt tabellagerbibliotek for genomics - delte biblioteker

GenomicsDB er bygget oven på en htslib-forgrening og et internet tabellagersystem for import, forespørgsel og transformering af variantdata. Variantdata er rumlige af natur (rumlige relativt til hele genomet) og brug af rumlige tabeldatalagre er en perfekt løsning for lagring af sådanne data.

GenomicsDB lagrer variantdata i en 2D-tabel hvor:

 - Hver kolonne svarer til en genomposition (kromosom + position)
 - Hver række svarer til en prøve i en VCF (eller CallSet i GA4GH-
   terminologi)
 - Hver celle indeholder data for en given prøve/CallSet på en given
   position; data er lagret i form af celleattributter
 - Celler er lagret  i kolonnerækkefølge - dette gør adgang til celler
   med det samme kolonneindeks (dvs. data for en given genomisk position
   over alle prøver) hurtig
 - Variantinterval/gVCF-intervaldata er lagret i en celle i begyndelsen af
   intervallet. END er lagret som en celleattribut. For variantintervaller
   (såsom sletninger og gVCF REF-blokke) bliver en yderligere celle lagret
   som END-værdien for variantintervallet. Når forespurgt om en given
   genomisk position, forespørgselsbiblioteket udfører en effektiv rydning
   for at bestemme alle intervaller, der har forbindelse med den
   forespurgte position.

Denne pakke indeholder det delte bibliotek.

Other Packages Related to libgenomicsdb1

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6.1 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: libfmt9 (>= 9.1.0+ds1)

  Hurtigt type-sikkert C++-formateringsbibliotek - bibliotek

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libmuparserx4.0.12 (>= 4.0.12)

  mathematical expression parser library

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4)

  Protokolbuffere - C++-bibliotek

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libuuid1 (>= 2.16)

  Universelt unik id-bibliotek

• dep: openmpi-bin

  Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - binære filer

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libgenomicsdb1

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.5.3-3+b1	1,509.2 kB	6,828.0 kB	[list of files]