Package: r-bioc-annotationhub (3.14.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-annotationhub  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

Denne pakke tilbyder en klient for Bioconductor AnnotationHub- internetressourcen. AnnotationHub-internetressourcen tilbyder en central lokation hvor genomiske filer (f.eks., VCF, bed, wig) og andre ressourcer fra standardlokationer (f.eks. UCSC, Ensembl) kan registreres. Ressourcen inkluderer metadata om hver ressource, f.eks., en tekstbeskrivelse, mærker og ændringsdato. Klienten opretter og håndtere et lokalt mellemlager med filer hentet af brugeren, hjælper med hurtig og reproducerbar adgang.

Other Packages Related to r-bioc-annotationhub

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.31.19)

  GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor

• dep: r-bioc-biocfilecache (>= 1.5.1)

  GNU R management of files across sessions

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.10)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocversion

  Angiv den passende version for Bioconductor-pakker

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-cran-biocmanager

  Tilgå pakkearkivet for Bioconductorprojektet

• dep: r-cran-curl

  GNU R modern and flexible web client for R

• dep: r-cran-dplyr

  GNU R-grammatik for datamanipulering

• dep: r-cran-httr

  GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP

• dep: r-cran-rappdirs

  GNU R application directories

• dep: r-cran-rsqlite

  Database Interface R-driver for SQLite

• dep: r-cran-yaml

  Methods to convert R data to YAML and back

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• sug: r-bioc-ensembldb

  GNU R-redskaber til at oprette og bruge en Ensembl-baseret annotationsdatabase

• sug: r-bioc-experimenthub

  BioConductor-klient til at tilgå ExperimentHub-ressourcer

• sug: r-bioc-genomeinfodb

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• sug: r-bioc-iranges

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• sug: r-bioc-rsamtools

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• sug: r-bioc-rtracklayer

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor - assay-container

• sug: r-bioc-txdbmaker

  Tools for making TxDb objects from genomic annotations

• sug: r-bioc-variantannotation

  BioConductor-annotation af genetiske varianter

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-annotationhub

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	436.0 kB	726.0 kB	[list of files]