Package: r-bioc-genomeinfodb (1.42.1+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-genomeinfodb  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

Denne pakke indeholder BioConductor-redskaber til at manipulere kromosom og andre »seqname«-identifikatorer.

Pakken Seqnames indeholder data og funktioner, der definerer og tillader oversættelse mellem forskellige kromosomsekvensnavnekonventioner (f.eks. »chr1« versus »1«), inklusive en funktion der forsøger at placere sekvensnavne i deres naturlige, frem for deres leksikografiske, rækkefølge.

Other Packages Related to r-bioc-genomeinfodb

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodbdata

  BioConductor - opslagstabeller for art og taksonomi-id

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.25.12)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-ucsc.utils

  Low-level utilities to retrieve data from the UCSC Genome Browser

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-bsgenome

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-genomicalignments

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• sug: r-bioc-rsamtools

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• sug: r-cran-data.table

  GNU R-udvidelse af Data.frame

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-r.utils

  GNU R - diverse programmeringsredskaber

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-genomeinfodb

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	3,753.8 kB	5,034.0 kB	[list of files]