Package: khmer (3.0.0~a3+dfsg-9~0exp and others)

[ Source: khmer  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

I-hukommelse DNA-sekvens kmer-optælling, filtrering og grafgennemløb

Khmer et et bibliotek og programpakke med værktøjer for kommandolinjen til arbejdet med DNA-sekvenser. Det er primært rettet mod kort-læs sekvensdata såsom dem lavet af Illuminaplatformen. Khmer bruger en k-mer-centrisk fremgangsmåde til sekvensanalyse, deraf navnet.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Filtering

Other Packages Related to khmer

• dep: khmer-common

  Fælles filer for værktøjerne til khmer-projektet

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-screed

  Korte nukleotide læsesekvensredskaber i Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download khmer

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3.0.0~a3+dfsg-9~0exp+b1	7,061.4 kB	40,948.0 kB	[list of files]