Package: r-bioc-rsamtools (2.22.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-rsamtools  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

Denne pakke tilbyder en grænseflade til redskaberne »samtools«, »bcftools« og »tabix« til at manipulere SAM (Sequence Alignment / Map), binært variantkald (BCF) og komprimerede indekserede indryk-afgrænsede filer (tabix).

Other Packages Related to r-bioc-rsamtools

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 2.99.1)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-bitops

  GNU R-pakke der implementerer bitwise-operationer

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-biocstyle

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-genomicalignments

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

  GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-rsamtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,514.3 kB	5,655.0 kB	[list of files]