Package: r-bioc-rsamtools (2.20.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-rsamtools  ]

GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

Denne pakke tilbyder en grænseflade til redskaberne »samtools«, »bcftools« og »tabix« til at manipulere SAM (Sequence Alignment / Map), binært variantkald (BCF) og komprimerede indekserede indryk-afgrænsede filer (tabix).

Other Packages Related to r-bioc-rsamtools

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)

  nemt at bruge adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden (OpenSSL-variant)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor - faciliteter for parallel evulering

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 3.0.0)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc (>= 1.50.0)

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-bitops

  GNU R-pakke der implementerer bitwise-operationer

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  Standardstile for vignettes og andre Biocunductor-dokumenter

• sug: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0)

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.62.0)

  GNU R - klasser og metoder for høj-gennemløb kort-læsning sekventeringsdata

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-rsamtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3,515.2 kB	5,655.0 kB	[list of files]