Package: r-bioc-tximport (1.34.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-tximport  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Estimater på transkriptniveau for biologisk sekventering

Importerer overflod på transkriptniveau, estimeret antal og transkriptlængder og summerer i matricer for brug med nedstrøms gen-niveau analysepakker. Gennemsnitlig transkriptlængde, vægtet med eksempel-specifik transkriptoverflodsestimater, tilbydes som en matrix, der kan bruges som en forskydning for forskellige udtryk for tællinger på genniveau.

Other Packages Related to r-bioc-tximport

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.11.6)

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• sug: r-bioc-edger

  Empirisk analyse af digitale gen-udtryksdata i R

• sug: r-bioc-limma

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-tximportdata

  GNU R various transcript abundance quantifiers

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald

• sug: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• sug: r-cran-readr (>= 0.2.2)

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R-testpakke

Download r-bioc-tximport

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	89.0 kB	152.0 kB	[list of files]