Paket: r-bioc-tximport (1.34.0+dfsg-1)

[ Källkod: r-bioc-tximport  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

transcript-level estimates for biological sequencing

Imports transcript-level abundance, estimated counts and transcript lengths, and summarizes into matrices for use with downstream gene-level analysis packages. Average transcript length, weighted by sample-specific transcript abundance estimates, is provided as a matrix which can be used as an offset for different expression of gene-level counts.

Andra paket besläktade med r-bioc-tximport

• dep: r-api-4.0

  Paketet inte tillgängligt

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics

• sug: r-bioc-deseq2 (>= 1.11.6)

  R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

• sug: r-bioc-edger

  Empirical analysis of digital gene expression data in R

• sug: r-bioc-limma

  linear models for microarray data

• sug: r-bioc-rhdf5

  BioConductor HDF5 interface to R

• sug: r-bioc-tximportdata

  GNU R various transcript abundance quantifiers

• sug: r-cran-jsonlite

  Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• sug: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• sug: r-cran-readr (>= 0.2.2)

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Hämta r-bioc-tximport

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
all	89,0 kbyte	152,0 kbyte	[filförteckning]