[ Source: sprai ]
Package: sprai (0.9.9.23+dfsg-2)
Links for sprai
Debian Resources:
Download Source Package sprai:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [zombie.cb.k.u-tokyo.ac.jp]
Similar packages:
Forbedring af single-pass-sekventeringslæsenøjagtighed
Sprai er et værktøj til at rette sekventeringsfejl i single-pass- læsninger for de novo-samling. Det er oprindeligt designet for rettelse af sekventeringsfejl i enkelt molekyle DNS-sekventeringslæsninger, specielt i Continous Long Reads (CLR'er) oprettet af PacBio RS- sekvensprogrammer. Formålet med Sprai er ikke at maksimere præcisionen for fejlrettede læsninger. I stedet forsøger Sprai at maksimere kontinuiteten (dvs., N50 contig-længder) for samlede contig'er efter fejlrettelse.
Other Packages Related to sprai
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)
- Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: time
- GNU's tidsprogram til måling af cpu-ressourceforbrug
-
- sug: make
- Redskab til at dirigere kompileringen
-
- sug: pbalign
- Oversæt Pacific Biosciences-læsninger til DNA-sekvenser med reference
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Pacific Biosciences variant and consensus caller
-
- sug: pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files
Download sprai
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| i386 | 1,480.1 kB | 1,715.0 kB | [list of files] |