Пакет: sprai (0.9.9.23+dfsg-2)

[ Источник: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Другие пакеты, относящиеся к sprai

• dep: libc6 (>= 2.7)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)

  поиск первичных биологических последовательностей

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• dep: time

  GNU time — программа для измерения использования ресурсов

• sug: make

  утилита управления компиляцией

• sug: pbalign

  map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences

• sug: pbgenomicconsensus

  Pacific Biosciences variant and consensus caller

• sug: pbh5tools

  tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files

Загрузка sprai

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
i386	1 480,1 Кб	1 715,0 Кб	[список файлов]