Package: r-bioc-rtracklayer (1.42.1-2)

[ Source: r-bioc-rtracklayer  ]

GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

Udvidelig ramme for interaktion med flere genombrowsere (i øjeblikket UCSC indbygget) og manipulering af annotationsspor i diverse formater (i øjeblikket GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig og 2bit indbygget). Brugeren kan eksportere/importere spor til/fra de understøttede browsere, samt forespørge og ændre browsertilstanden, såsom den nuværende viewport.

Other Packages Related to r-bioc-rtracklayer

• dep: libc6 (>= 2.28)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-3.5

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.8

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

  Generiske funktioner for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)

  Bioconductor-repræsentation og manipulering af korte arvemassesammenligninger

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13)

  GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

  GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.19.22)

  BioConductor S4-implementering af vektorer og lister

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtuel) zlibbioc - Bioconductor-pakke

• dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2)

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

  GNU R-pakke for XML-fortolkning og oprettelse

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker

• sug: r-bioc-genefilter

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer

• sug: r-bioc-limma

  Lineære modeller for microarray-data

• sug: r-cran-runit

  GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-rtracklayer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	2,401.8 kB	3,857.0 kB	[list of files]