Package: giira (0.0.20140625-2)

[ Source: giira  ]

RNA-Seq-drevet gen-registrering der indarbejder tvetydige læsninger

GIIRA er en gen-forudsigelsesmetode, der identificerer potentielle kodningsregioner udelukkende baseret på kortlægning af læsninger fra et RNA-Seq-eksperiment. Det blev hovedsagelig konstrueret til prokaryotisk gen-forudsigelse og er i stand til at vise gener inden i den viste region for et operon. Det kan også bruges til eukaryoter og forudsiger exon-intron- strukturer samt alternative isoformer.

Other Packages Related to giira

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: glpk-utils

  Lineært programmeringssæt - redskabsfiler

• dep: libglpk-java

  Javabinding til GNU Linear Programming Kit

• dep: tophat

  Hurtig splejsningsforbindelsesoversætter for RNA-sekvenslæsninger

Download giira

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	140.1 kB	172.0 kB	[list of files]