Package: med-bio (3.3)

[ Source: debian-med  ]

Debian Med - pakker for bioinformatik

Denne metapakke vil installere Debianpakker til brug indenfor molekylær biologi, strukturel biologi og andre biologiske videnskaber.

Tags: Field: Biology, Role: Metapackage, Application Suite: Debian

Other Packages Related to med-bio

• dep: med-config (= 3.3)

  Debian Med - generel konfigurationspakke

• dep: med-tasks (= 3.3)

  Debian Med-opgaver for tasksel

• rec: abacas

  Luk huller i genomsammenligninger fra korte læsninger

• rec: abyss

  De novo, parallel, sekvensassembler for korte læsninger

• rec: acedb-other

  Indhentelse af DNA- eller proteinsekvenser

• rec: adapterremoval

  Hurtig adaptertrimming, identifikation og læsesammenføjning af gensekvenser

• rec: adun-core

  Molekylær simulator

• rec: aegean

  Integreret værktøjssæt til analyse af arvemasse

• rec: aevol

  Digital genetisk model til at udføre evolutionseksperimenter i silico

• rec: alien-hunter

  Interpolated Variable Order Motifs til identificering af vandret indsamlede DNA

• rec: alter-sequence-alignment

  ALignment Transformation EnviRonment for arvemassesekvener

• rec: altree

  Program til at udføre fylogeni-baserede forenings- og lokaliseringsanalyse

• rec: amap-align

  Proteinflerjustering af sekvensudglødning

• rec: ampliconnoise

  Fjernelse af støj fra 454-sekvenserede PCR-amplicons

• rec: andi

  Effektiv estimering af evolutionære afstande

• rec: anfo

  Short Read Aligner/Mapper fra MPG

• rec: aragorn

  tRNA- og tmRNA-detektion i nukleotide sekvenser

• rec: arden

  Specificitetskontrol for læse sammenligninger ved anvendelse af en kunstig reference

• rec: ariba

  Antibiotic Resistance Identification By Assembly

• rec: art-nextgen-simulation-tools

  Simuleringsværktøjer til at oprette syntetiske næstegenerationssekventeringslæsninger

• rec: artemis

  Arvemassebrowser og annotationsværktøj

• rec: artfastqgenerator

  Viser kunstige FASTQ-filer afledt fra et referencegenom

• rec: assemblytics

  Registrer og analyser strukturelle varianter fra en genomsamling

• rec: atac

  Samling til samling-sammenligning for genomer

• rec: augustus

  Genforudsigelse i eukaryote genomer

• rec: autodock

  Analyse af ligand-binding til proteinstruktur

• rec: autodock-vina

  Dokning af små molekyler til proteiner

• rec: autogrid

  Beregn på forhånd liganders binding til deres receptor

• rec: avogadro

  Molekylært grafik- og modelsystem

• rec: axe-demultiplexer

  Trie-baseret DNA-sekventerende læsningsdemultiplexer

• rec: baitfisher

  Programpakke til design af hybride berigelsessonder

• rec: bali-phy

  Bayesiansk inferens for justering og fylogeni

• rec: ballview

  Frit værktøj til molekylærmodellering og molekylærgrafik

• rec: bamtools

  Værktøjssæt for manipulering af BAM-filer - sammenligning af arvemasser

• rec: bandage

  Bioinformatikprogram til nemt at navigere de novo-samlingsgrafer

• rec: barrnap

  Hurtig ribosomal RNA-forudsigelse

• rec: bcbio

  Værktøjssæt til at analysere sekvensdata med høj gennemløb

• rec: bcftools

  Genomisk variantkald og manipulering af VCF/BCF-filer

• rec: beads

  2-DE electrophoresis gel image spot-detektion

• rec: beagle

  Genotypekald, genotypefase og imputering af ikke genotype-markører

• rec: beast-mcmc

  Bayesiansk MCMC-fylogenetisk inferens

• rec: beast2-mcmc

  Bayesiansk MCMC-fylogenetisk inferens

• rec: bedops

  Højtydende genomisk funktionsoperationer

• rec: bedtools

  Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner

• rec: belvu

  Fremviser for flere sekvenssammenligninger og et fylogenetisk værktøj

• rec: berkeley-express

  Strømkvantificering til sekventering med høj gennemløb

• rec: bio-eagle

  Haplotype-udfasning inden for en genotypekohorte eller ved hjælp af et trinvist henvisningspanel

• rec: bio-rainbow

  Klyngeopsætning og samling af korte læsninger for bioinformatik

• rec: bio-tradis

  Analyser resultatet fra TraDIS-analyser med genomsekvenser

• rec: biosyntax

  Syntaksfremhævelse for beregningsbiologi - metapakke

• rec: bitseq

  Bayesiansk udledning af transkripter fra sekvensdata

• rec: blasr

  Kortlægning af enkelte molekylesekventeringslæsninger

• rec: blixem

  Interaktiv browser for sekvenssammenligninger

• rec: bolt-lmm

  Effektiv stor kohorte-genom-bredt bayesiansk blandet-model tilknytningstest

• rec: bowtie

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• rec: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• rec: boxshade

  Pæn udskrift af flere sekvensersammenstillinger

• rec: bppphyview

  Bio++ Phylogenetic Viewer

• rec: bppsuite

  Programpakke for Bio++

• rec: brig

  BLAST Ring Image Generator

• rec: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

• rec: canu

  Enkel molekyle sekvenssamler for genomer

• rec: cassiopee

  Indeks- og søgeværktøj i arvemassesekvenser

• rec: cct

  Visuelt sammenligne bakterie-, plasmid-, chloroplast- eller mitokondrie sekvenser

• rec: cd-hit

  Programpakke designet til hurtigt at gruppere sekvenser

• rec: cdbfasta

  Constant DataBase-indekserings- og indhentelsesværktøj for multi-FASTA-filer

• rec: centrifuge

  Hurtigt og hukommelseseffektivt system til klassifikation af DNA-sekvenser

• rec: cgview

  Cirkulær genomfremviser

• rec: changeo

  Repertoire klonal assignment toolkit - Python 3

• rec: chimeraslayer

  Detekterer sandsynlige kimærer i PCR-amplificeret DNA

• rec: chromhmm

  Kromatintilstandsregistrering og karakterisering

• rec: chromimpute

  Systematisk epigenom-imputation i stor skala

• rec: circlator

  Cirkularisere genomsamlinger

• rec: circos

  Plotprogram for visualisering af data

• rec: clearcut

  Ekstrem effektiv fylogenetisk trærekonstruktion

• rec: clonalframe

  Udledning af bakterisk mikroevolution med multilocus sekvensdata

• rec: clonalframeml

  Effektiv følgeslutning for rekombination i hele bakterielle genomer

• rec: clonalorigin

  Følgeslutning af homolog rekombination i bakterier ved anvendelse af hele genomsekvenser

• rec: clustalo

  Alment sekvenssammenligningsprogram for proteiner

• rec: clustalw

  Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

• rec: clustalx

  Flere sammenligninger af nukledie syre- og proteinsekvenser - grafisk brugerflade

• rec: cnvkit

  Kopier nummervariantregistrering fra målrettet DNA-sekventering

• rec: codonw

  Korrespondanceanalyse af Codonanvendelse

• rec: concavity

  Forudsigelse af proteinligandbindingssteder fra struktur og bevaring

• rec: conservation-code

  Værktøj til bedømmelse af bevaring af proteinsekvens

• rec: crac

  Integreret RNA-Seq-læsanalyse

• rec: csb

  Computational Structural Biology Toolbox (CSB)

• rec: cutadapt

  Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb

• rec: daligner

  Lokal tilpasningsregistrering mellem lange nukleotidsekventeringslæsninger

• rec: datamash

  Statistisk værktøj for kommandolinjegrænseflader

• rec: dawg

  Simuler udviklingen af rekombinante DNA-sekvenser

• rec: dazzdb

  Håndter data for nukleotidsekventeringslæsning

• rec: deepnano

  Alternativ basecaller for MinION-læsninger af genomsekvenser

• rec: delly

  Strukturel variantregistrering af læseanalyse

• rec: dialign

  Segmentbaseret flersekvensjustering

• rec: dialign-tx

  Segmentbaseret flersekvensjustering

• rec: diamond-aligner

  Accelereret BLAST-kompatibel lokal sekvenssammenligner

• rec: dindel

  Bestemmer indel-kald fra kort-læst data

• rec: discosnp

  Find enkel nukleotidpolymorfisme fra rå læsning af sæt

• rec: disulfinder

  Cysteines disulfidbindingtilstand og forbindelsesprædiktor

• rec: dnaclust

  Værktøj til klyngedannelse af korte DNA-sekvenser

• rec: dotter

  Detaljeret sammenligning af to genomsekvenser

• rec: dssp

  Sekundære proteinstruktur-opgave baseret på 3D-struktur

• rec: dwgsim

  Simulator til kort sekventeringslæsninger

• rec: e-mem

  Effektiv beregning af Maximal Exact Matches for meget store genomer

• rec: ea-utils

  Værktøjer til kommandolinjen for behandling af biologiske sekvensdata

• rec: ecopcr

  Estimer PCR-stregkodeprimers kvalitet

• rec: edtsurf

  Triangulerede mesh-overflader til proteinstrukturer

• rec: eigensoft

  Reduktion af befolkningsbias for genetiske analyser

• rec: elph

  DNA/protein-sekvens motif finder

• rec: embassy-domainatrix

  Ekstra EMBOSS-kommandoer til håndtering af domæneklassifikationsfil

• rec: embassy-domalign

  Ekstra EMBOSS-kommandoer til proteindomæne-justering

• rec: embassy-domsearch

  Ekstra EMBOSS-kommandoer til søgning i proteindomæner

• rec: emboss

  Programpakke til europæisk molekylærbiologi

• rec: estscan

  ORF-uafhængig detektor for kodning af DNA-sekvenser

• rec: examl

  Exascale Maximum Likelihood-kode (ExaML) for fylogenetisk følgeslutning

• rec: exonerate

  generisk værktøj til parvis sekvenssammenligning

• rec: fastahack

  Redskab for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer

• rec: fastaq

  Manipuleringsværktøjer til FASTA- og FASTQ-filer

• rec: fastdnaml

  Værktøj for konstruktion af fylogentiske træer for DNA-sekvenser

• rec: fastlink

  Hurtigere version af pedigree-programmer for Linkage

• rec: fastml

  Maximum likelihood-nedarvet aminosyresekvensgenopbygning

• rec: fastp

  Ultrahurtig alt i en FASTQ-forbrænder

• rec: fastqc

  Kvalitetskontrol for høj gennemløb af sekvensdata

• rec: fastqtl

  Quantitative Trait Loci-oversætter (QTL) i cis for molekylære fænotyper

• rec: fasttree

  Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser

• rec: fastx-toolkit

  forbehandlingsværktøjer til læsning af korte FASTQ/A-nukleotider

• rec: ffindex

  Simpelt indeks/database for store mængder af små filer

• rec: figtree

  Grafisk fylogenetisk træfremviser

• rec: fitgcp

  Tilpasning af arvemasse-dækningsdistributioner med blandingsmodeller

• rec: flexbar

  Fleksibel stregkode og adapterfjernelse for sekvensplatforme

• rec: fml-asm

  Værktøj til at samle Illuminakorte læsninger i små områder

• rec: freebayes

  Bayesian haplotype-baseret polymorfiregistrering og genotypebestemmelse

• rec: freecontact

  Hurtig protein-kontaktprædiktor

• rec: fsa

  Hurtig statistisk sammenligning af protein-, RNA- eller DNA-sekvenser

• rec: fsm-lite

  Frekvensbaseret strengminering - lite

• rec: gamgi

  General Atomistic Modelling Graphic Interface (GAMGI)

• rec: garli

  Fylogenetisk analyse af molekylære sekvensdata der bruger maximum-likelihood

• rec: garlic

  Visualiseringsprogram for biomolekyler

• rec: gasic

  Lighedskorrektion for arvemasseoverflod

• rec: gatb-core

  Genomanalyseværktøjskasse med de-Bruijn-graf

• rec: gbrowse

  GMOD Generic Genome Browser

• rec: gdpc

  visualiseringsprogram til simulering af molekylær dynamik

• rec: gemma

  Genome-wide Efficient Mixed Model Association

• rec: genometester

  Værktøjssæt til at udføre sætoperationer på k-mer-lister

• rec: genometools

  Alsidigt værktøjs til arvemasseanalyse

• rec: gentle

  Programpakke til at planlægge genetisk kloning

• rec: gff2aplot

  Parvise justeringsplot for arvemassesekvenser i PostScript

• rec: gff2ps

  laver PostScript-grafisk uddata fra GFF-filer

• rec: ghemical

  Modelleringsmiljø for molekyler til GNOME

• rec: ghmm

  Generelt Hidden-Markov-Model-bibliotek - værktøjer

• rec: giira

  RNA-Seq-drevet gen-registrering der indarbejder tvetydige læsninger

• rec: glam2

  Proteinmotiver med afstand fra ikke-justerede sekvenser

• rec: grabix

  Wee-værktøj for vilkårlig adgang i BGZF-filer

• rec: graphlan

  Cirkulære repræsentationer af taksonomiske og fylogenetiske træer

• rec: grinder

  Alsidige omics shotgun og amplikon sekventeringslæsningssimulator

• rec: gromacs

  Simulator af molekyldynamik med bygge- og analyseværktøjer

• rec: gubbins

  Fylogenetisk analyse af genomsekenser

• rec: gwama

  Genome-Wide Association Meta Analysis

• rec: harvest-tools

  Arkivering og efterbehandling for referencekomprimerede genomiske fler-justeringer

• rec: hhsuite

  Sensitiv proteinsekvenssøgning baseret på HMM-HMM-sammenligning

• rec: hilive

  Realtid sammenligning af Illumina-læsninger

• rec: hinge

  Assembler til læsning af lange genomer baseret på hinging

• rec: hisat2

  Grafbaseret sammenligning af korte nukleoide læsninger for mange genomer

• rec: hmmer

  Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse

• rec: hmmer2

  Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse

• rec: hyphy-mpi

  Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - MPI-version

  or hyphy-pt

  Hypotesetest ved hjælp af fylogenier - pthreads-version

• rec: idba

  Iterativ De Bruijn Graph De Novo-kortlæserassemblere

• rec: igor

  Infers V(D)J-rekombinationsproces fra sekvensdata

• rec: indelible

  Funktionsrig og fleksibel simulator for biologisk evolution

• rec: infernal

  Logisk slutning for RNA-sekundære struktursammenligninger

• rec: ipig

  Integrering af PSM'er til arvemassebrowservisualiseringer

• rec: iqtree

  Effektivt fylogenetisk program ved maksimal sandsynlighed

• rec: iva

  Iterativ virussekvensassembler

• rec: jaligner

  Smith-Waterman-algoritme med Gotohs forbedring

• rec: jellyfish

  Tæl k-mers i DNA-sekvenser

• rec: jellyfish1

  Tæl k-mers i DNA-sekvenser

• rec: jmodeltest

  HPC-udvalg af modeller for nukleotid substitution

• rec: jmol

  Molekylær fremviser

• rec: kalign

  Global og progressiv flersekvensjustering

• rec: khmer

  I-hukommelse DNA-sekvens kmer-optælling, filtrering og grafgennemløb

• rec: kineticstools

  Detektion af DNA-ændringer

• rec: king-probe

  Evaluer og visualiser pakning af proteiners interne atomare opbygning

• rec: kissplice

  Detektion af diverse slags polymorfismer i RNA-sekvensdata

• rec: kmc

  Tæl kmers i arvemassesekvenser

• rec: kmer

  Programpakke med værktøjer for DNA-sekvensanalyse

• rec: kraken

  Tildeling af taksonomiske etiketter til korte DNA-sekvenser

• rec: lagan

  Parameteropsat parvist og globalt sammenligningsprogram for genomsekvenser

• rec: lamarc

  Sandsynlighedsanalyse med Metropolisalgoritme via tilfældig sammenblanding

• rec: lambda-align

  Lokal sammenligningsprogram for Massive Biological DatA

• rec: lambda-align2

  Local Aligner for Massive Biological DatA - version 2

• rec: last-align

  sammenligning af biologisk sekvenser på genom-skala

• rec: leaff

  Redskaber og programmer for biologisk sekvensbibliotek

• rec: lefse

  Bestem funktioner for organismer, grupper, taksonomiske enheder, gener

• rec: librg-utils-perl

  Fortolkere og redskaber til formatkonvertering brugt af (f.eks.) profphd

• rec: libvcflib-tools

  C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - værktøjer

• rec: logol

  Værktøj til mønstermatch der bruger sproget Logol

• rec: loki

  MCMC-koblingsanalyse vedrørende generelle stamtavler

• rec: ltrsift

  Efterbehandling og klassifikation af LTR-retrotransposons

• rec: lucy

  DNA-værktøj til sekvenskvalitet og vektortrimning

• rec: macs

  Modelbaseret analyse af ChIP-Seq på korte læsesekvenser

• rec: macsyfinder

  Registrering af makromolekylære systemer i proteindatasæt

• rec: maffilter

  Behandl genomsammenligning i Multiple Alignment Format

• rec: mafft

  Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser

• rec: mapdamage

  tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences

• rec: mapsembler2

  Bioinformatik målrettet programmer til samling

• rec: maq

  kortlægger korte, fast-længde, polymorfiske DNA-sekvenslæsninger til reference-sekvenser

• rec: maqview

  Grafisk fremviser for læsesammenligninger for korte gensekvenser

• rec: mash

  Hurtig genom- og metagenomafstandsestimering via MinHash

• rec: mauve-aligner

  Sammenligning af flere genomer

• rec: melting

  beregn smeltepunktet for nukleinsyre-duplekser

• rec: meryl

  Tælning og redskaber til ind og ud af kerne i kmer

• rec: metaphlan2

  Metagenomic Phylogenetic Analysis

• rec: metastudent

  Indikator for genontologivilkår fra proteinsekvens

• rec: mhap

  Lokalitetsfølsom hashing for at registrere long-read-overlap

• rec: microbegps

  Udforskende taksonomisk profileringsværktøj til metagenomiske data

• rec: microbiomeutil

  Microbiome - analyseredskaber

• rec: minia

  Kort-læst biologisk sekvensamler

• rec: miniasm

  Ultrahurtig de novo assembler for lange støjfyldte DNA-sekvenslæsninger

• rec: minimac4

  Fast Imputation baseret på State Space Reduction HMM

• rec: minimap

  Værktøj til omtrentlig oversættelse af lange biosekvenser såsom DNA-læsninger

• rec: minimap2

  Alsidig parvis sammenligner for genomiske og opdelte nukleotide sekvenser

• rec: mipe

  Værktøjer til at gemme PCR-afledte data

• rec: mira-assembler

  Hel Genome Shotgun og EST Sequence Assembler

• rec: mlv-smile

  Find statistisk signifikante mønstre i sekvenser

• rec: mothur

  Programpakke for sekvensanalyse til forskning i mikrobiota

• rec: mptp

  single-locus species delimitation

• rec: mrbayes

  Bayesiansk inferens for fylogeni

• rec: mummer

  Effektiv sekvensjustering for hele genomer

• rec: murasaki

  Detektionsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer

  or murasaki-mpi

  Afsløringsværktøj for homologi på tværs af flere store genomer - MPI-udgave

• rec: muscle

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

• rec: mustang

  Strukturel justering på flere måder af proteiner

• rec: nanook

  pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data

• rec: nanopolish

  Konsensuskalder for nanopore-sekvensdata

• rec: nast-ier

  NAST-baseret DNA-sammenligningsværktøj

• rec: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

• rec: ncbi-blast+-legacy

  NCBI Blast-forældet kaldskript

• rec: ncbi-entrez-direct

  NCBI Entrez-redskaber på kommandolinjen

• rec: ncbi-epcr

  Værktøj til at teste en DNA-sekvens for tilstedeværelsen af sekvensmærkede steder

• rec: ncbi-seg

  tool to mask segments of low compositional complexity in amino acid sequences

• rec: ncbi-tools-bin

  NCBI-biblioteker for biologiprogrammer - tekstbaserede redskaber

• rec: ncbi-tools-x11

  NCBI-biblioteker for biologiprogrammer - X-baserede redskaber

• rec: ncl-tools

  Værktøj til at håndtere NEXUS-filer

• rec: ncoils

  Coiled coil - sekundær strukturforudsigelse

• rec: neobio

  Beregner opstillinger af aminosyre- og nukleotidsekvenser

• rec: njplot

  Fylogenetisk trætegningsprogram

• rec: norsnet

  tool to identify unstructured loops in proteins

• rec: norsp

  predictor of non-regular secondary structure

• rec: obitools

  Programmer til at analysere NGS-data i en DNA-metabarcoding-kontekst

• rec: openms

  Pakke for LC/MS-datahåndtering og -analyse

• rec: pal2nal

  Konverterer proteiner til genomisk DNA-sammenligning

• rec: paleomix

  Datakanaler og værktøjer til at behandle ældre og moderne HTS-data

• rec: paml

  Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)

• rec: paraclu

  Parametrisk klyngedannelse af genomiske og transkriptomfunktioner

• rec: parsinsert

  Påholdende Indsættelse af uklassificerede sekvenser i fylogenetiske træer

• rec: parsnp

  Hurtig grundlæggende gensammenligning

• rec: patman

  Hurtig sammenligning af korte sekvenser med store databaser

• rec: pbalign

  Oversæt Pacific Biosciences-læsninger til DNA-sekvenser med reference

• rec: pbbarcode

  annotate PacBio sequencing reads with barcode information

• rec: pbdagcon

  sequence consensus using directed acyclic graphs

• rec: pbgenomicconsensus

  Pacific Biosciences variant and consensus caller

• rec: pbh5tools

  tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files

• rec: pbhoney

  genomic structural variation discovery

• rec: pbjelly

  genome assembly upgrading tool

• rec: pbsim

  Simulator for PacBio-sekvenslæsninger

• rec: pbsuite

  Program for Pacific Biosciences-sekvensdata

• rec: pdb2pqr

  Præparation af proteinstrukturer for elektrostatiske beregninger

• rec: perlprimer

  Grafisk design af primere for PCR

• rec: perm

  Effektiv kortlægning af korte læsninger med periodiske fordelte seedninger

• rec: pftools

  Byg og søg protein- og DNA-generaliserede profiler

• rec: phast

  phylogenetic analysis with space/time models

• rec: phipack

  PHI-test og andre test med rekombination

• rec: phybin

  binning/clustering newick trees by topology

• rec: phylip

  Programpakke for udledning af fylogenier

• rec: phyml

  Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood

• rec: physamp

  sample sequence alignment corresponding to phylogeny

• rec: phyutility

  simple analyses or modifications on both phylogenetic trees and data matrices

• rec: phyx

  Fylogenetiske analyser på træer og sekvenser i UNIX-stil

• rec: picard-tools

  Kommandolinjeværktøjer til at manipulere SAM- og BAM-filer

• rec: piler

  Genomisk gentagelsesanalyse

• rec: pilon

  automated genome assembly improvement and variant detection tool

• rec: pirs

  Profilbaseret Illumina-læsesimulator for pair-end

• rec: placnet

  Plasmid Constellation Network-projekt

• rec: plasmidomics

  Tegn plasmider og vektorkort med PostScript-grafikeksport

• rec: plasmidseeker

  identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads

• rec: plast

  Parallel Local Sequence Alignment Search Tool

• rec: plink

  Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer

• rec: plink1.9

  Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer

• rec: plip

  fully automated protein-ligand interaction profiler

• rec: poa

  Partial Order Alignment for flere sekvenssammenligninger

• rec: populations

  Program til befolkningsgenetik

• rec: porechop

  Adaptertrimmer for Oxford Nanopore-læsninger

• rec: poretools

  Værktøjssæt til nanopores nukleotidsekventeringsdata

• rec: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• rec: predictnls

  Forudsigelse og analyse af proteinnukleare lokaliseringssignaler

• rec: predictprotein

  suite of protein sequence analysis tools

• rec: prime-phylo

  Bayesiansk estimation af gentræer der tager højde for artstræet

• rec: primer3

  Værktøj til at designe flankerende, oligo-nukleotider til DNA-amplifikation

• rec: proalign

  Probabilistic multiple alignment program

• rec: probabel

  Værktøjssæt for Genome-Wide Association Analysis

• rec: probalign

  Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder

• rec: probcons

  Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)

• rec: proda

  multi-sammenligning af protein-sekvenser

• rec: prodigal

  Mikrobiel (bakteriel og archaeorganisme) genkonstateringsprogram

• rec: profbval

  Forudsigelse for fleksible/stive proteinrester fra sekvens

• rec: profisis

  Forudsigelse af protein-protein interaktionssider fra sekvens

• rec: profnet-bval

  Neural netværksarkitektur for profbval

• rec: profnet-chop

  Neural netværksarkitektur for profchop

• rec: profnet-con

  Neural netværksarkitektur for profcon

• rec: profnet-isis

  Neural netværksarkitektur for profisis

• rec: profnet-md

  Neuralt netværksarkitektur for metadisorder

• rec: profnet-norsnet

  Neural netværksarkitektur for norsnet

• rec: profnet-prof

  Neural netværksarkitektur for profacc

• rec: profnet-snapfun

  Neural netværksarkitektur for snapfun

• rec: profphd

  secondary structure and solvent accessibility predictor

• rec: profphd-net

  Neural netværksarkitektur for profphd

• rec: profphd-utils

  Profphd-hjælperedskaberne convert_seq og filter_hssp

• rec: proftmb

  Per rest forudsigelse af bakterielle transmembrane beta-tønder

• rec: progressivemauve

  Sammenligningsalgoritmer for flere genomer

• rec: proteinortho

  Registrering af (Co-)ortologer i storskala proteinanalyse

• rec: prottest

  selection of best-fit models of protein evolution

• rec: pscan-chip

  ChIP-based identifcation of TF binding sites

• rec: pscan-tfbs

  search for transcription factor binding sites

• rec: psortb

  Forudsigelsesværktøj for lokalisering af bakterier

• rec: pycorrfit

  Værktøj for tilpasning af korrelationskurver på et logaritmisk plot

• rec: pymol

  System til molekylærgrafik

• rec: pynast

  alignment of short DNA sequences

• rec: pyscanfcs

  Videnskabeligt værktøj til vinkelret linjeskanning FCS

• rec: python-cogent

  Ramme for genomisk biologi

• rec: python3-biomaj3-daemon

  BioMAJ-dæmonbibliotek

• rec: python3-gffutils

  Arbejd med GFF- og GTF-filer i en fleksibel databaseramme

• rec: python3-presto

  Værktøjssæt til at behandle B- og T-cellesekvenser

• rec: python3-pybedtools

  Python 3-omslag omkring BEDTools for bioinformatikarbejde

• rec: python3-pybel

  Biologisk udtrykssprog

• rec: python3-sqt

  SeQuencing-værktøjer for biologiske DNA/RNA-data med høj gennemløb

• rec: pyvcf

  Hjælpeskripter for Variant Call Format-fortolkeren (VCF)

• rec: qcumber

  Kvalitetskontrol af genomsekvenser

• rec: qtltools

  Værktøjssæt for molekylær QTL-registrering og analyse

• rec: quorum

  QUality Optimized Reads of genomic sequences

• rec: qutemol

  interaktiv visualisering af makromolekyler

• rec: r-bioc-annotate

  BioConductor-annotation for microarray'er

• rec: r-bioc-biostrings

  GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser

• rec: r-bioc-bitseq

  transcript expression inference and analysis for RNA-seq data

• rec: r-bioc-cner

  CNE-registrering og visualisering

• rec: r-bioc-cummerbund

  Værktøjer for analyse af Cufflinks RNA-Seq-uddata

• rec: r-bioc-deseq2

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• rec: r-bioc-dnacopy

  R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer

• rec: r-bioc-ebseq

  R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse

• rec: r-bioc-genefilter

  Metoder for filtrering af gener fra microarray-eksperimenter

• rec: r-bioc-geneplotter

  R-pakke med funktioner til plot af genomdata

• rec: r-bioc-gviz

  Plot data og annotationsinformation langs genomiske koordinater

• rec: r-bioc-hilbertvis

  GNU R-pakke til at visualisere lange vektordata

• rec: r-bioc-impute

  Imputering for microarray-data

• rec: r-bioc-limma

  Lineære modeller for microarray-data

• rec: r-bioc-mergeomics

  Integrerende netværksanalyse af omics-data

• rec: r-bioc-metagenomeseq

  GNU R-statistisk analyse for tynd høj-gennemløb sekventering

• rec: r-bioc-pcamethods

  BioConductor-samling af PCA-metoder

• rec: r-bioc-phyloseq

  GNU R-håndtering og analyse af høj-gennemløb microbiome censusdata

• rec: r-bioc-rtracklayer

  GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor

• rec: r-bioc-tfbstools

  GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis

• rec: r-cran-adegenet

  GNU R-undersøgende analyse af genetisk og genomdata

• rec: r-cran-adephylo

  GNU R-sonderende analyser for den fylogenetiske kompatrative metode

• rec: r-cran-alakazam

  Immunoglobulin Clonal Lineage og Diversity Analysis

• rec: r-cran-ape

  GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• rec: r-cran-bio3d

  GNU R-pakke for biologisk strukturanalyse

• rec: r-cran-distory

  GNU R-afstand mellem fylogenetiske historier

• rec: r-cran-genabel

  GNU R package for genome-wide SNP association analysis

• rec: r-cran-metamix

  GNU R - bayesiansk blandingsanalyse for metagenomisk fællesskabsprofilering

• rec: r-cran-phangorn

  GNU R-pakke for fylogenetisk analyse

• rec: r-cran-phytools

  GNU R-fylogenetiske værktøjer til komparativ biologi

• rec: r-cran-pscbs

  R-pakke - analyse af overordnede og specifikke DNA-kopinumre

• rec: r-cran-qtl

  GNU R-pakke for genetisk markørbindingsanalyse

• rec: r-cran-rotl

  GNU R-grænseflade til »Open Tree of Life«-API'en

• rec: r-cran-samr

  GNU R-signifikansanalyse af mikrotabeller

• rec: r-cran-sdmtools

  Species Distribution Modelling Tools

• rec: r-cran-seqinr

  GNU R-biologiske sekvenser - indhentelse og analyse

• rec: r-cran-shazam

  Immunoglobulin somatisk hypermutationsanalyse

• rec: r-cran-tcr

  Advanced Data Analysis of Immune Receptor Repertoires

• rec: r-cran-tigger

  Udleder nye immunoglobulin-alleler fra Rep-Seq-data

• rec: r-cran-treescape

  GNU R - statistisk udforskning af landskaber med fylogenetiske træer

• rec: r-cran-vegan

  Fællesskabsøkologi for R

• rec: r-other-hms-dbmi-spp

  virtual package provided by r-cran-spp

• rec: r-other-mott-happy.hbrem

  GNU R-pakke for finkortlægning af komplekse sygdomme

• rec: racon

  consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads

• rec: radiant

  Udforsk hierarkiske metagenomdata med lagkagediagrammer

• rec: rambo-k

  Read Assignment Method Based On K-mers

• rec: rampler

  module for sampling genomic sequences

• rec: rapmap

  Hurtig sensitiv og præcis DNA-læsningsoversættelse via quasi-mapping

• rec: rasmol

  Visualisering af biologiske makromolekyler

• rec: raster3d

  Værktøjer for oprettelse af billeder for proteiner eller andre molekyler

• rec: rate4site

  Detektor af konserverede aminosyresteder

• rec: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer

• rec: ray

  de novo genome assemblies of next-gen sequencing data

• rec: rdp-alignment

  Ribosomal Database Project (RDP) værktøjspakke for sammenligning

• rec: rdp-classifier

  Udvidelig sekvensklassifikation for fungal lsu, bakterie og arkæisk 16s

• rec: rdp-readseq

  Ribosomal Database Project (RDP) sequence reading and writing

• rec: readseq

  Konvertering mellem sekvensformater

• rec: reapr

  Universielt værktøj for genomsamlingsevaluering

• rec: relion-bin

  Værktøjssæt for 3D-rekonstruktioner i cryo-elektron mikroskopi

  or relion-bin+mpi

  Parallelt værktøjssæt for 3D-rekonstruktioner i kryo-elektron mikroskopi

• rec: relion-bin+gui

  Parallelt værktøjssæt for 3D-rekonstruktioner i kryo-elektron mikroskopi

  or relion-bin+mpi+gui

  Parallelt værktøjssæt for 3D-rekonstruktioner i kryo-elektron mikroskopi

• rec: repeatmasker-recon

  finds repeat families from biological sequences

• rec: reprof

  Proteinsekundær struktur- og tilgængelighedsprædiktor

• rec: rna-star

  Ultrahurtig univerel RNA-seq-sammenligningsprogram

• rec: rnahybrid

  Hurtig og effektiv forudsigelse om microRNA-/mål-dubletter

• rec: roary

  Højhastigheds og uafhængig pan-genomdatakanal

• rec: roguenarok

  Alsidig og skalerbar algoritmer for rogue taxon-identifikation

• rec: rsem

  RNA-Seq ved Expectation-Maximization

• rec: rtax

  Klassifikation af sekvenslæsninger for 165 ribosomal RNA-gen

• rec: runcircos-gui

  Grafisk brugerfladeværktøj til at afvikle circos

• rec: saint

  Significance Analysis of INTeractome

• rec: salmon

  Wicked-hurtig transskriptkvantificering fra RNA-seq-data

• rec: samblaster

  Markerer dubletter, udtrækker discordant/split-læsninger

• rec: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• rec: scoary

  Pangenom-brede associationsstudier

• rec: scrm

  Simulator af evolution for genetiske sekvenser

• rec: scythe

  Byesiansk adaptortrimmer for sekvenslæsninger

• rec: seaview

  Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni

• rec: seer

  Genomisk sekvenselementberigelsesanalyse (kmer)

• rec: segemehl

  Kort læs-kortlægning med gaps

• rec: seqan-apps

  C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser

• rec: seqmagick

  Imagemagick-lignende brugerflade til Biopython SeqIO

• rec: seqprep

  Strippe adaptere og/eller sammenføjede parrede læsninger af DNA-sekvenser med overlap

• rec: seqsero

  Salmonella serotyping fra genomsekvensdata

• rec: seqtk

  Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ

• rec: sga

  De novo-genomsamler som bruger strenggrafer

• rec: sibsim4

  Sammenlign udtrykte RNA-sekvenser på en DNA-skabelon

• rec: sickle

  Vinduesopdelt adaptiv trimmingværktøj for FASTQ-filer der bruger kvalitet

• rec: sigma-align

  Simpel grådig flerjustering af ikke-kodende DNA-sekvenser

• rec: sim4

  Værktøj for justering af cDNA og genomisk DNA

• rec: sim4db

  Jobopdelt sammenligning af cDNA-sekvenser til et målgenom

• rec: smalr

  Efterforskning af methyleringsstatus for nukleotidsekventeringlæsninger

• rec: smalt

  Værktøj til sekvensoversættelse og sammenligning

• rec: smithwaterman

  Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser

• rec: snap

  Placering af gener fra DNA-sekvens med skjult Markovmodel

• rec: snap-aligner

  Scalable Nucleotide Alignment Program

• rec: sniffles

  Strukturel variationskalder der bruger tredjegenerations sekventering

• rec: snp-sites

  Binær kode for pakken snp-sites

• rec: snpomatic

  Hurtig, stringent kort-læsning oversættelsesprogram

• rec: soapaligner

  Sammenligning af korte læsninger for næste generations sekvensere

• rec: soapdenovo

  Short-read samlingsmetode til at bygge de novo-kladdesamling

• rec: soapdenovo2

  Short-read samlingsmetode til at bygge de novo-kladdesamling

• rec: soapsnp

  Resekvensredskab der kan samle genomkonsensussekvenser

• rec: sortmerna

  Værktøj til at filtrere, oversætte og OTU-udvælge NGS-læsninger

• rec: spaced

  Justeringsfri sekvenssammenligning ved hjælp af afskårne ord

• rec: spades

  Genomsamler for single-celle- og isolates-datasæt

• rec: spoa

  SIMD-sammenligningsværktøj for partial order

• rec: sprai

  Forbedring af single-pass-sekventeringslæsenøjagtighed

• rec: spread-phy

  Analyser og visualiser fylogeografiske rekonstruktioner

• rec: squizz

  Konverteringsprogram for gentiske sekvenser og justeringer

• rec: sra-toolkit

  Redskaber for NCBI Sequence Read Archive

• rec: srst2

  Kort læsesekvensindtastning for bakterielle patogener

• rec: ssake

  Genomprogram for samling af millioner af meget korte DNA-sekvenser

• rec: sspace

  Scaffolding på forhånd samlede contig'er efter filendelse

• rec: ssw-align

  Smith-Waterman-justeringsprogram baseret på libssw

• rec: stacks

  Datakanal for bygning af loci fra kort-læs DNA-sekvenser

• rec: staden

  DNA-sekvenssamling (Gap4/Gap5), redigerings- og analyseværktøjer

• rec: staden-io-lib-utils

  Programmer til at manipulerer DNS-sekvensfiler

• rec: subread

  Værktøjssæt til at behandle næstegen. sekvensdata

• rec: suitename

  Kategoriser hver programpakke i en RNA-backbone

• rec: sumaclust

  Hurtig og præcis klyngeopsætning af genomsekvenser

• rec: sumatra

  Hurtig og præcis sammenligning og sekvensklynger

• rec: sumtrees

  Fylogenetisk træsummering og annotation

• rec: surankco

  Overvåget rangering af Contigs i de novo-samlinger

• rec: swarm

  Robust og hurtig klyngemetode for amplicon-baserede studier

• rec: sweed

  Vurdering af SNP'er for deres evolutionære fordele

• rec: t-coffee

  Flersekvensjustering

• rec: tabix

  Generisk indeksprogram for TAB-afgrænsede arvemassepositionsfiler

• rec: tantan

  Lav kompleksitet og tandem-gentagelsesmasker for biosekvenser

• rec: theseus

  Overlejring af makromolekyler med brug af maksimal sandsynlighed

• rec: tigr-glimmer

  Gen-detektion i arkæer og bakterier

• rec: tm-align

  Strukturel sammenligning af proteiner

• rec: tnseq-transit

  Statistiske beregninger af væsentlighed for gener eller genomregioner

• rec: toil

  Arbejdsgangsmotor for flere platforme

• rec: tophat

  Hurtig splejsningsforbindelsesoversætter for RNA-sekvenslæsninger

• rec: topp

  Sæt af programmer der implementerer OpenMS Proteomic Pipeline

• rec: toppred

  Forudsigelse af transmembrantopologi

• rec: trace2dbest

  Saml indsendelse af chromatogramdata til dbEST

• rec: tracetuner

  Fortolkning af DNA Sanger-sekventeringsdata

• rec: transdecoder

  Find kodningsregioner i RNA-transkriptsekvenser

• rec: transrate-tools

  Hjælpeprogram til transrate

• rec: transtermhp

  Find rho-uafhængige transkriptionsterminatorer i bakterielle genomer

• rec: tree-puzzle

  Rekonstruktion af fylogenetiske træer gennem maksimal lighed

  or tree-ppuzzle

  Paralleliseret rekonstruktion af fylogenetiske træer gennem maksimal lighed

• rec: treeview

  Ny Javaimplementering af Michael Eisens TreeView

• rec: treeviewx

  Viser og udskriver fylogenetiske træer

• rec: trimmomatic

  Fleksibelt værktøj til læsetrimning af Illumina NGS-data

• rec: trinityrnaseq

  RNA-Seq De novo Assembly

• rec: tvc

  Genetisk variantkalder for Ion Torrent-sekventeringsplatforme

• rec: uc-echo

  Fejlkorrektionsalgoritme designet for kort-læsninger fra NGS

• rec: unanimity

  Opret og behandl præcis konsensus nukleotidsekvenser

• rec: unicycler

  Hybrid samlingsdatakanal for bakterigenomer

• rec: varna

  Visualiseringspanelprogram for RNA

• rec: vcftools

  Samling af værktøjer til arbejdet med VCF-filer

• rec: velvet

  Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger

  or velvet-long

  Sekvens-assembler for nukleinsyre til meget korte læsninger - lang version

• rec: velvetoptimiser

  Optimer automatisk Velvet do novo-samlingsparametre

• rec: viewmol

  Grafisk brugerflade for bregningskemiprogrammer

• rec: vsearch

  Værktøj til behandling af metagenomiske sekvenser

• rec: wigeon

  Ny implementering af Pintail 16S-detektionsredskabet for DNA-anamolier

• rec: wise

  Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser

• rec: yaha

  Find split-read-oversættelser på single-end-forespørgsler

• rec: zalign

  Parallel lokal sammenligning af biologiske sekvenser

• sug: acacia

  Package not available

• sug: adun.app

  Molekylær simulator for GNUstep - grafisk brugerflade

• sug: amos-assembler

  Package not available

• sug: amoscmp

  Package not available

• sug: annovar

  Package not available

• sug: apollo

  Package not available

• sug: arachne

  Package not available

• sug: arb

  phylogenetic sequence analysis suite - main program

• sug: asap

  Package not available

• sug: atropos

  Package not available

• sug: autodocktools

  Package not available

• sug: axparafit

  Package not available

• sug: axpcoords

  Package not available

• sug: bagpipe

  Package not available

• sug: bambus

  Package not available

• sug: bax2bam

  Package not available

• sug: biceps

  Package not available

• sug: big-blast

  Package not available

• sug: bigsdb

  Package not available

• sug: biobambam2

  Package not available

• sug: bismark

  Package not available

• sug: blat

  Package not available

• sug: blimps-utils

  blocks database improved searcher

• sug: blobology

  Package not available

• sug: braker

  Package not available

• sug: btk-core

  Package not available

• sug: cactus

  Package not available

• sug: caftools

  Package not available

• sug: cain

  Simulationer af kemiske reaktioner

• sug: card-rgi

  Package not available

• sug: ccs

  Package not available

• sug: cdna-db

  Package not available

• sug: cellprofiler

  Package not available

• sug: cinema

  Package not available

• sug: cluster3

  Reimplementation of the Eisen-clustering software

• sug: cmap

  Package not available

• sug: compclust

  Package not available

• sug: condetri

  Package not available

• sug: contrafold

  Package not available

• sug: contralign

  Package not available

• sug: coot

  Package not available

• sug: copycat

  Package not available

• sug: crossbow

  Package not available

• sug: crux-toolkit

  Package not available

• sug: cufflinks

  Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

• sug: cytoscape

  Package not available

• sug: dascrubber

  Sammenligningsbaseret scrubbing-datakanal for DNA-sekvenslæsninger

• sug: dazzle

  Package not available

• sug: deepbinner

  Package not available

• sug: dendroscope

  Package not available

• sug: e-hive

  Package not available

• sug: ecell

  Package not available

• sug: embassy-phylip

  EMBOSS conversions of the programs in the phylip package

• sug: emboss-explorer

  Netbaseret grafisk brugerflade for EMBOSS

• sug: emmax

  Package not available

• sug: emperor

  Package not available

• sug: ensembl

  Package not available

• sug: estferret

  Package not available

• sug: euler-sr

  Package not available

• sug: euler2

  Package not available

• sug: exabayes

  Package not available

• sug: exalt

  Package not available

• sug: excavator

  Package not available

• sug: falcon

  Package not available

• sug: fasta3

  tools for searching collections of biological sequences

• sug: ffp

  Package not available

• sug: figaro

  Package not available

• sug: filtlong

  Package not available

• sug: forester

  Package not available

• sug: forge

  Package not available

• sug: galaxy

  Package not available

• sug: gassst

  Package not available

• sug: gatk

  Package not available

• sug: gbrowse-syn

  Package not available

• sug: genemark

  Package not available

• sug: genesplicer

  Package not available

• sug: genetrack

  Package not available

• sug: genezilla

  Package not available

• sug: genographer

  Package not available

• sug: getdata

  Håndtering af eksterne databaser

• sug: gffread

  Package not available

• sug: glimmerhmm

  Package not available

• sug: gmap

  Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger

• sug: gmv

  Package not available

• sug: gramalign

  Package not available

• sug: haploview

  Package not available

• sug: hawkeye

  Package not available

• sug: htqc

  Package not available

• sug: igdiscover

  Package not available

• sug: igv

  Package not available

• sug: inspect

  Package not available

• sug: jalview

  Package not available

• sug: jbrowse

  Package not available

• sug: jigsaw

  Package not available

• sug: kallisto

  Package not available

• sug: kempbasu

  Package not available

• sug: kma

  Package not available

• sug: kmerresistance

  Package not available

• sug: kraken2

  Package not available

• sug: lofreq

  Package not available

• sug: mach-haplotyper

  Package not available

• sug: mage2tab

  Package not available

• sug: maker2

  Package not available

• sug: malt

  Package not available

• sug: manta

  Package not available

• sug: martj

  Package not available

• sug: maude

  Højtydende logisk ramme

• sug: maxd

  Package not available

• sug: meme

  Package not available

• sug: mesquite

  Package not available

• sug: metabit

  Package not available

• sug: metarep

  Package not available

• sug: metastudent-data

  Indikator for genontologivilkår fra proteinsekvens - datafiler

• sug: metastudent-data-2

  Indikator for genontologivilkår fra proteinsekvens - data #2

• sug: metastudent-data-3

  Package not available

• sug: mgltools-cadd

  Computer Aided Drug Discovery (CADD) Pipeline

• sug: mgltools-pmv

  Package not available

• sug: mgltools-vision

  Python-based Visual Programming Environment

• sug: migrate

  Package not available

• sug: minimus

  Package not available

• sug: mirbase

  Package not available

• sug: mirtop

  Package not available

• sug: mobyle

  Netportal som tilbyder netformularer for kommandolinjeprogrammer

• sug: mobyle-programs

  Programbeskrivelser for mobyle-portalen

• sug: mobyle-tutorials

  Programøvelser for mobyle-portalen

• sug: modeller

  Package not available

• sug: molekel

  Package not available

• sug: mosaik-aligner

  Package not available

• sug: mosdepth

  Package not available

• sug: mpsqed

  Package not available

• sug: mrs

  Information Retrieval System for Biomedical databanks

• sug: msatfinder

  Package not available

• sug: msxpertsuite

  Package not available

• sug: mugsy

  Package not available

• sug: multiqc

  Package not available

• sug: mummergpu

  Package not available

• sug: mview

  Package not available

• sug: nanocall

  Package not available

• sug: ncbi-igblast

  Package not available

• sug: nextsv

  Package not available

• sug: ngila

  Package not available

• sug: ngsqctoolkit

  Package not available

• sug: nw-align

  Package not available

• sug: oases

  Package not available

• sug: obo-edit

  Package not available

• sug: oligoarrayaux

  Package not available

• sug: omegamap

  Package not available

• sug: oncofuse

  Package not available

• sug: operondb

  Package not available

• sug: optimir

  Package not available

• sug: optitype

  Package not available

• sug: paipline

  Package not available

• sug: partigene

  Package not available

• sug: partitionfinder

  Package not available

• sug: patristic

  Package not available

• sug: pcma

  Package not available

• sug: pfaat

  Package not available

• sug: phagefinder

  Package not available

• sug: phpphylotree

  Package not available

• sug: phylographer

  Package not available

• sug: phylophlan

  Package not available

• sug: phyloviz-core

  Package not available

• sug: phylowin

  Package not available

• sug: pilercr

  Package not available

• sug: pipasic

  Package not available

• sug: plato

  Package not available

• sug: profit

  Package not available

• sug: prokka

  Package not available

• sug: prot4est

  Package not available

• sug: psipred

  Package not available

• sug: pssh2

  Package not available

• sug: pyrophosphate-tools

  Package not available

• sug: python-orange

  Package not available

• sug: python-reaper

  Package not available

• sug: python-treetime

  Package not available

• sug: python3-geneimpacts

  Package not available

• sug: qiime

  Package not available

• sug: qtlcart

  Package not available

• sug: qualimap

  Package not available

• sug: quast

  Package not available

• sug: r-bioc-annotationhub

  GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer

• sug: r-bioc-aroma.light

  BioConductor-metoder - normalisering og visualisering af microarray-data

• sug: r-bioc-ensembldb

  GNU R-redskaber til at oprette og bruge en Ensembl-baseret annotationsdatabase

• sug: r-bioc-go.db

  Annotationskort der beskriver hele genontologien

• sug: r-bioc-savr

  GNU R - fortolk og analyser Illumina SAV-filer

• sug: r-cran-boolnet

  Samling, analyse og visualisering af booleske netværk

• sug: r-cran-forecast

  Package not available

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R-pakke til at oprette smukke varmekort

• sug: r-cran-qqman

  R-pakke til at visualisere GWAS-resultater via Q-Q- og Manhattan-plot

• sug: r-cran-rentrez

  GNU R-grænseflade til NCBI's EUtils API

• sug: r-cran-webgestaltr

  Package not available

• sug: r-other-apmswapp

  Package not available

• sug: raccoon

  Package not available

• sug: ragout

  Package not available

• sug: raxml-ng

  Package not available

• sug: rbs-finder

  Package not available

• sug: repeatmasker

  Package not available

• sug: rmblast

  Package not available

• sug: roadtrips

  Package not available

• sug: roche454ace2caf

  Package not available

• sug: rose

  Package not available

• sug: rsat

  Package not available

• sug: sailfish

  Package not available

• sug: sambamba

  Package not available

• sug: sap

  Package not available

• sug: science-workflow

  Håndteringssystem til arbejdsforløb der er nyttig i videnskabelig forskning

• sug: seq-gen

  simulate the evolution of nucleotide or amino acid sequences

• sug: seq-seq-pan

  Package not available

• sug: sequenceconverter.app

  Package not available

• sug: sibelia

  Package not available

• sug: sift

  predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect

• sug: sina

  Package not available

• sug: sistr

  Package not available

• sug: situs

  Package not available

• sug: smrtanalysis

  Package not available

• sug: snpeff

  Package not available

• sug: solvate

  arranges water molecules around protein structures

• sug: sourmash

  Package not available

• sug: spaln

  Package not available

• sug: sparta

  Package not available

• sug: splitstree

  Package not available

• sug: ssaha

  Package not available

• sug: strap

  Package not available

• sug: strap-base

  Package not available

• sug: stringtie

  Package not available

• sug: tab2mage

  Package not available

• sug: tacg

  Package not available

• sug: taverna

  Package not available

• sug: taxinspector

  Package not available

• sug: tetra

  Package not available

• sug: tide

  Package not available

• sug: tigr-glimmer-mg

  Package not available

• sug: tn-seqexplorer

  Package not available

• sug: treebuilder3d

  Package not available

• sug: treetime

  Package not available

• sug: tripal

  Package not available

• sug: trnascan-se

  detection of transfer RNA genes in genomic sequence

• sug: twain

  Package not available

• sug: ugene

  Package not available

• sug: umap

  Package not available

• sug: umis

  Package not available

• sug: unc-fish

  Package not available

• sug: uniprime

  Package not available

• sug: varmatch

  Package not available

• sug: varscan

  variant detection in next-generation sequencing data

• sug: vcfanno

  Package not available

• sug: vdjtools

  Package not available

• sug: vienna-rna

  Package not available

• sug: virulencefinder

  Package not available

• sug: vmd

  Package not available

• sug: x-tandem-pipeline

  Package not available

• sug: zodiac-zeden

  Package not available

Download med-bio

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	19.9 kB	48.0 kB	[list of files]