Package: pbalign (0.3.2-1)

[ Source: pbalign  ]

Oversæt Pacific Biosciences-læsninger til DNA-sekvenser med reference

Pbalign sammenligner PacBio-læsninger med referencesekvenser, filtrerer sammenlignede læsninger jævnfør brugerspecifikke filtreringskriterier og konverterer resultatet til enten SAM-formatet eller PacBio Compare HDF5- formatet (f.eks., .cmp.h5).

Denne pakke er en del af SMRTAnalysis-programpakken.

Other Packages Related to pbalign

• dep: blasr (>= 5.3+0)

  Kortlægning af enkelte molekylesekventeringslæsninger

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: python-pbalign (= 0.3.2-1)

  map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)

• dep: python-pkg-resources

  Pakkesøgning og ressourceadgang med brug af pkg_resources

• rec: hdf5-tools

  Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Kørselstidsværktøjer

• rec: python-pbh5tools

  tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library

• sug: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• sug: gmap

  Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger

• sug: pbalign-doc

  Dokumentation for pbalign

Download pbalign

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	9.3 kB	44.0 kB	[list of files]