Package: khmer (2.1.2+dfsg-6)

[ Source: khmer  ]

I-hukommelse DNA-sekvens kmer-optælling, filtrering og grafgennemløb

Khmer et et bibliotek og programpakke med værktøjer for kommandolinjen til arbejdet med DNA-sekvenser. Det er primært rettet mod kort-læs sekvensdata såsom dem lavet af Illuminaplatformen. Khmer bruger en k-mer-centrisk fremgangsmåde til sekvensanalyse, deraf navnet.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Filtering

Other Packages Related to khmer

• dep: cython3 (>= 0.26.1)

  C-udvidelser for Python 3

• dep: khmer-common

  Fælles filer for værktøjerne til khmer-projektet

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC støttebibliotek

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af python3

  dep: python3 (<< 3.8)

  dep: python3 (>= 3.7~)

• dep: python3-bz2file

  Python3 library for reading and writing bzip2-compressed files

• dep: python3-screed (>= 1.0)

  Korte nukleotide læsesekvensredskaber i Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download khmer

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
arm64	6,408.0 kB	29,286.0 kB	[list of files]