Package: gasic (0.0.r19-4)

[ Source: gasic  ]

Lighedskorrektion for arvemasseoverflod

Et mål for sekvensbaseret metagenomisk analyse er den kvantitative taksonomiske vurdering af mikrobielle miljøsammensætninger. Imidlertid er flertallet af indgangsvinklerne enten kvantificer ved lav opløsning (f.eks. på rækkeniveau) eller de har alvorlige problemer angående meget lignende arter. Alligevel er nøjagtig kvantificering på artsniveau ønskelig i anvendelser såsom metagenomisk diagnostik eller fællesskabssammenligning. GASiC er en metode til at korrigere læste justeringsresultater for de uklarheder, der indførtes ved ligheder i arvemasser. Metoden har overlegen ydelse i forhold til eksisterende metoder.

Other Packages Related to gasic

• dep: bowtie

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: bowtie2

  Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

• dep: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

• dep: python

  Interaktivt objektorienteret sprog på højt niveau - Python 2-version

• dep: python-biopython

  Pythonbibliotek for bioinformatikere - implementeret i Python 2

• dep: python-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab

• dep: python-numpy

  Numerisk Python tilføjer en hurtig vektor-/array-facilitet til Pythonsproget

• dep: python-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvensopstilling og oversættelsesformat - Python 2

• dep: python-scipy

  Videnskabelige værktøjer for Python

• dep: seqan-apps

  C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser

Download gasic

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	19.8 kB	74.0 kB	[list of files]