Package: sigma-align (1.1.3-8)

[ Source: sigma-align  ]

Simpel grådig flerjustering af ikke-kodende DNA-sekvenser

Sigma (»Simple greedy multiple alignment«, simpel grådig flerjustering) er et justeringsprogram. Dets algoritme og scoringsskema er designet specifikt til ikke-kodende DNA-sekvenser.

Den bruger en strategi til søgning efter bedst mulige, gabsfrie, lokale justeringer. Dette sker ved hvert trin, for at gøre den bedst mulige justering konsistent med eksisterende justeringer. Den scorer signifikansen af justeringen baseret på længden af de justerede fragmenter og en baggrundsmodel. Disse kan tildeles eller estimeres fra en tillægsfil med intergenisk DNA.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to sigma-align

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.12.0)

  GLib-bibliotek for C-rutiner

Download sigma-align

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	23.8 kB	62.0 kB	[list of files]
arm64	22.9 kB	58.0 kB	[list of files]
armel	23.0 kB	57.0 kB	[list of files]
armhf	21.1 kB	49.0 kB	[list of files]
i386	24.6 kB	61.0 kB	[list of files]
mips64el	24.2 kB	68.0 kB	[list of files]
mipsel	23.6 kB	63.0 kB	[list of files]
ppc64el	26.8 kB	90.0 kB	[list of files]
s390x	23.0 kB	62.0 kB	[list of files]