Paquet : sigma-align (1.1.3-8)

[ Paquet source : sigma-align  ]

alignement de multiples séquences d'ADN non codant

SIGMA (« SImple Greedy Multiple Alignment ») est un logiciel d'alignement. Son algorithme et schéma de notation sont conçus spécialement pour une séquence d'ADN non codant.

Il utilise une stratégie de recherche d'alignements locaux avec le moins d'espacement possible. Ceci se produit à chaque étape, ce qui rend le meilleur alignement possible compatible avec les alignements existants. Il note l'importance de l'alignement sur ​​la base des longueurs des fragments alignés et un modèle de fond. Ceux-ci peuvent être communiqués ou estimés à partir d'un fichier complémentaire de l'ADN intergénique.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, use::comparing, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à sigma-align

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.12.0)

  bibliothèque GLib de routines C

Télécharger sigma-align

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	23,8 ko	62,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	22,9 ko	58,0 ko	[liste des fichiers]
armel	23,0 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	21,1 ko	49,0 ko	[liste des fichiers]
i386	24,6 ko	61,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	24,2 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	23,6 ko	63,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	26,8 ko	90,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	23,0 ko	62,0 ko	[liste des fichiers]