[ Source: cat-bat ]
Package: cat-bat (5.2.2-1)
Links for cat-bat
Debian Resources:
Download Source Package cat-bat:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Taksonomisk klassifikation af contigs og metagenom-samlede genomer (MAG'er)
Contig Annotation Tool (CAT) og Bin Annotation Tool (BAT) der datakanaler for taksonomisk klassifikation af lange DNA-sekvenser og metagenom-samlede genomer (MAG'er/bin'er) for både kendte og (meget) ukendte mikroorganismer, som oprettet af moderne metagenomstudier. Grundalgoritmen for begge programmer involverer gen-kald, oversættelse af forudsagte ORF'er mod nr protein-databasen og stemmebaseret klassifikation af hele contig'en/MAG'en baseret på klassifikation af de individuelle ORF'er. CAT og BAT kan afvikles fra mellemliggende trin, hvis filerne er korrekt formateret.
Other Packages Related to cat-bat
|
|
|
|
-
- dep: diamond-aligner
- Accelereret BLAST-kompatibel lokal sekvenssammenligner
-
- dep: prodigal
- Mikrobiel (bakteriel og archaeorganisme) genkonstateringsprogram
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
Download cat-bat
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 28.8 kB | 180.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 28.8 kB | 180.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 28.8 kB | 180.0 kB | [list of files] |
| s390x | 28.8 kB | 180.0 kB | [list of files] |