Package: qiime (2020.11.1-1)

[ Source: qiime  ]

Kvantitativ indsigt i mikrobiel økologi

QIIME 2 er en funktionsrig og decentraliseret mikrobiome analysepakke med fokus på data og analysegennemsigtighed. QIME 2 gør det muligt for forskere at starte en analyse med rå DNA-sekvensdata og afslutte med figurer og statistiske resultater i udgivelseskvalitet. Nøglefunktioner:

 * Integreret og automatisk registrering af dataherkomst
 * Semantisk typesystem
 * Udvidelsesmodulsystem for udvidelse af mikrobiome analysefunktionalitet
 * Understøttelse for flere typer af brugerflader (f.eks. API,
   kommandolinjen, grafisk)

QIIME 2 er et fuldstændigt nyt design og omskrivning af QIIME 1 mikrobiome analysedatakanalen. QIIME 2 vil adressere mange af begrænsningerne i QIIME 1, men de funktioner der gør QIIME 1 til en funktionsrig og bredt anvendt analysedatakanal bevares.

QIIME 2 understøtter i øjeblikket en oprindelig start til slut-mikrobiome analysedatakanal. Ny funktionalitet vil blive tilgængelig via QIIME 2-udvidelsesmoduler. Du kan se en liste over tilgængelige udvidelsesmoduler på QIIME 2's side over udvidelsesmoduler. »future«-siden viser udvidelsesmoduler under udvikling.

Tags: Role: Program

Other Packages Related to qiime

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

• dep: python3-bibtexparser

  Python 3 library to parse bibtex files

• dep: python3-dateutil

  Funktionsrige udvidelser til Python 3's standardmodul datetime

• dep: python3-decorator

  forenkl brug af Pythondekoratører med programmører

• dep: python3-networkx

  Værktøj til at oprette, manipulere og studere komplekse netværk - Python 3

• dep: python3-pandas

  Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«

• dep: python3-pyparsing

  Alternativ til at oprette og køre simple grammatikker - Python 3.x

• dep: python3-tzlocal

  Tzinfo-objekt for den lokale tidszone

• dep: python3-yaml

  YAML-fortolker og udleder for Python 3

• rec: q2-cutadapt

  QIIME 2-udvidelsesmodul til arbejdet med adaptere i sekvensdata

• rec: q2-demux

  QIIME 2-udvidelsesmodul for demultiplexing af sekvenslæsninger

• rec: q2-feature-classifier

  QIIME 2-udvidelsesmodul der understøtter taksonomisk klassifikation

• rec: q2-feature-table

  QIIME 2-udvidelsesmodul der understøtter operationer på funktionstabeller

• rec: q2-metadata

  QIIME 2-udvidelsesmodul for arbejdet med og visualisering af metadata

• rec: q2-quality-filter

  QIIME 2-udvidelsesmodul for PHRED-baseret filtrering og tilpasning

• rec: q2-types

  QIIME 2-udvidelsesmodul der definerer typer for mikrobiom analyse

• rec: q2cli

  Klikbaseret kommandolinjegrænseflade for QIIME 2

• rec: q2templates

  Designskabelonpakke for QIIME 2-udvidelsesmoduler

Download qiime

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	147.0 kB	1,057.0 kB	[list of files]