Package: mummer (3.23+dfsg-7)
Links for mummer
Debian Resources:
Download Source Package mummer:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
External Resources:
- Homepage [mummer.sourceforge.net]
Similar packages:
Effektiv sekvensjustering for hele genomer
MUMmer er et system til hurtig justering af hele genomer, uanset om det er i komplet eller udkastform. For eksempel kan MUMmer 3.0 finde alle eksakte sammenfald for 20-basepar eller længere mellem et par af 5-megabase genomer på 13,7 sekunder, med brug af 78MB hukommelse, på en stationær 2,4GHz Linux-maskine. MUMmer kan også justere genomer som ikke er komplette; den håndterer de hundrede- eller tusindevis af »contig'er« fra et »shotgun«- sekventeringsprojekt med lethed, og vil justere dem til et andet sæt af »contig'er« eller et genom med brug af NUCmer-programmet som er inkluderet i systemet. Hvis arterne er for divergerende til registrering af lighed gennem DNA-sekvensjustering, så kan PROmer-programmet danne justeringer baseret på »six-frame«-oversættelser af begge input-sekvenser.
Other Packages Related to mummer
|
|
|
|
-
- dep: gawk
- GNU awk, et mønsterscannings- og mønsterbehandlingssprog
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
Download mummer
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 648.7 kB | 3,321.0 kB | [list of files] |