Пакунок: mummer (3.23+dfsg-7)
Links for mummer
Debian Resources:
Download Source Package mummer:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
External Resources:
- Homepage [mummer.sourceforge.net]
Similar packages:
Efficient sequence alignment of full genomes
MUMmer is a system for rapidly aligning entire genomes, whether in complete or draft form. For example, MUMmer 3.0 can find all 20-basepair or longer exact matches between a pair of 5-megabase genomes in 13.7 seconds, using 78 MB of memory, on a 2.4 GHz Linux desktop computer. MUMmer can also align incomplete genomes; it handles the 100s or 1000s of contigs from a shotgun sequencing project with ease, and will align them to another set of contigs or a genome using the NUCmer program included with the system. If the species are too divergent for DNA sequence alignment to detect similarity, then the PROmer program can generate alignments based upon the six-frame translations of both input sequences.
Інші пакунки пов'язані з mummer
|
|
|
|
-
- dep: gawk
- GNU awk — мова розпізнавання та обробки шаблонів
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
Завантажити mummer
Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|
amd64 | 648.7 kB | 3,321.0 kB | [список файлів] |