Package: seqprep (1.3.2-8)

[ Source: seqprep  ]

Strippe adaptere og/eller sammenføjede parrede læsninger af DNA-sekvenser med overlap

SeqPrep er et program til at sammenlægge parrede Illuminalæsninger, der overlapper hinanden ind i en enkelt længere læsning. Det kan også bruges til sin adaptertilpasningsfunktion uden at udføre nogen parrede slut-overlapninger. Når en adaptersekvens er nuværende, det betyder, at de to læsninger skal overlappe (i de fleste tilfælde) så de er kraftigt fusioneret. Når læsninger ikke har adaptersekvens, skal de behandles omhyggeligt, når man laver sammenføjningen, så en langt mere specifik fremgangsmåde er valgt. Standardparametrene blev valgt med tanke på specificitet, så at de kunne køres på biblioteker, hvor meget få læsninger forventes at overlappe hinanden. Det er dog altid sikreste at gemme den overlappende procedure for biblioteker, hvor du har forudgående kendskab til, at en væsentlig del af læsningerne vil have overlapning.

Other Packages Related to seqprep

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download seqprep

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	27.4 kB	95.0 kB	[list of files]
arm64	25.8 kB	103.0 kB	[list of files]
armel	27.7 kB	166.0 kB	[list of files]
armhf	26.2 kB	102.0 kB	[list of files]
i386	27.2 kB	90.0 kB	[list of files]
mips64el	26.6 kB	169.0 kB	[list of files]
mipsel	26.8 kB	168.0 kB	[list of files]
ppc64el	26.3 kB	103.0 kB	[list of files]
s390x	26.5 kB	103.0 kB	[list of files]