Package: kleborate (2.3.1-2)

[ Source: kleborate  ]

Værktøj til at screene Klebsiella-genomsamlinger

Kleborate er et værktj til at screene Klebsiella-genomsamlinger for:

 * MLST-sekvenstype
 * arter (f.eks. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp-associeret virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmidassocieret loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimikrobiologisk resistensgener, inklusive quinoloneresistens-SNP'er
   og trunkeringer mod colistinresistens
 * K (capsule) og O antigen (LPS) serotypeforudsigelse, via wzi alleles
   og Kaptive

Other Packages Related to kleborate

• dep: kaptive

  Indhent information om K- og O-typer for Klebsiella-genomsamlinger

• dep: kaptive-data

  Referencedata for kaptive for Klebsiella-genomsamlinger

• dep: mash

  Hurtig genom- og metagenomafstandsestimering via MinHash

• dep: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  Python 3-bibliotek for bioinformatik

• dep: python3-distutils

  Distutils-pakke for Python 3.x

Download kleborate

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
s390x	7,546.3 kB	61,970.0 kB	[list of files]