[ Source: python-pyfaidx ]
Package: python3-pyfaidx (0.7.1-2)
Links for python3-pyfaidx
Debian Resources:
Download Source Package python-pyfaidx:
- [python-pyfaidx_0.7.1-2.dsc]
- [python-pyfaidx_0.7.1.orig.tar.gz]
- [python-pyfaidx_0.7.1-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Effektiv vilkårlig adgang til fasta-undersekvenser for Python 3
Samtools tilbyder en funktion »faidx« (FAsta InDeX), der opretter en lille flad indeksfil ».fai« der tillader hurtig vilkårlig adgang til enhver undersekvens i den indekserede FASTA-fil, mens der indlæses en minimal mængde af filen i hukommelsen. Dette Pythonmodul implementerer rene Pythonklasser for indeksering, indhentelse og på stedet ændring af FASTA-filer via et samtools-kompatibelt indeks. Modulet pyfaidx er API-kompatibelt med pygr seqdb-modulet. Et kommandolinjeskript »faidx« er installeret sammen med modulet pyfaidx og faciliterer kompleks manipulering af FAST-filer uden nogen programmeringsviden.
Denne pakke tilbyder Python 3-modulerne til at tilgå fasta-filer.
Other Packages Related to python3-pyfaidx
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-pkg-resources
- Pakkesøgning og ressourceadgang med brug af pkg_resources
-
- dep: python3-six
- Python 2- og 3-kompatibilitetsbibliotek
-
- rec: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
Download python3-pyfaidx
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 27.4 kB | 121.0 kB | [list of files] |