Package: plink2 (2.00~a3.5-220809+dfsg-1 and others)

[ Source: plink2  ]

Værktøjssæt til associationsanalyse for hele genomer

Plink forventer data fra SNP-chip (single nucleotide polymorphism) for mange individuelle og deres fænotypiske beskrivelse af en sygdom. Programmet finder associationer for enkelte eller par af DNA-variationer med en fænotype og kan hente SNP-annotation fra en netkilde.

SNP'er kan evalueres individuelt eller som par for deres association med sygdomsfænotyper. Den samlede undersøgelse af kopiantalvariationer er understøttet. En række statistiske test er blevet implementeret.

Plink2 er en omfattende opdatering af plink og plink1.9 med nye algoritmer og nye metoder, hurtigere og mindre hukommelsesforbrug end den første plink.

Other Packages Related to plink2

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  Understøttelsesbibliotek der tilbyder __atomic indbyggede funktioner

• dep: libblas3

  Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Hurtig, fuld buffer DEFLATE-baseret kompression og dekompression

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC støttebibliotek

• dep: liblapack3

  Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: libzstd1 (>= 1.5.2)

  Hurtig komprimeringsalgoritme uden kvalitetstab

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download plink2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
armel	2.00~a3.5-220809+dfsg-1+b2	863.6 kB	2,398.0 kB	[list of files]