Balík: plink2 (2.00~a3.5-220809+dfsg-1 a iné)

[ Zdroj: plink2  ]

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink2 is a comprehensive update of plink and plink1.9 with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom plink2

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libblas3

  referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica

  alebo libblas.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  podporná knižnica GCC

• dep: liblapack3

  knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica

  alebo liblapack.so.3

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libzstd1 (>= 1.5.2)

  rýchly bezstratový komprimačný algoritmus

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť plink2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
armel	2.00~a3.5-220809+dfsg-1+b2	863.6 kB	2,398.0 kB	[zoznam súborov]