[ Source: mafft ]
Package: mafft (7.407-2)
Links for mafft
Debian Resources:
Download Source Package mafft:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [mafft.cbrc.jp]
Similar packages:
Program pro uspořádání aminokyselin a sekvencí nukleotidů
MAFFT je program pro vícenásobné sekvenční uspořádání, který provádí tři metody:
* L-INS-i (pravděpodobně nejpřesnější; vhodná pro < 200 sekvencí; iterativní propracovaná metoda začlenění informací o místním uspořádání párů), * G-INS-i (vhodná pro sekvence podobných délek; vhodná pro < 200 sekvencí; iterativní propracovaná metoda začlenění informací o globálním uspořádání párů), * E-INS-i (vhodná pro uspořádání obsahující rozsáhlé neuspořadatelné oblasti; doporučuje se pro < 200 sekvencí), a pět rychlostně-orientovaných metod: * FFT-NS-i (iterativní metoda; pouze dva cykly), * FFT-NS-i (iterativní metoda; maximálně 1000 cyklů), * FFT-NS-2 (rychlá; progresivní metoda), * FFT-NS-1 (velmi rychlá; doporučeno pro > 2000 sekvencí; progresivní metody s hrubým průchodem stromu), * NW-NS-PartTree-1 (doporučena pro ~50 000 sekvencí; progresivní metoda s algoritmem PartTree).
Other Packages Related to mafft
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- rec: blast2
- transitional dummy package to ncbi-blast+-legacy
-
- rec: libwww-perl
- simple and consistent interface to the world-wide web
-
- rec: lynx
- classic non-graphical (text-mode) web browser
-
- rec: ruby
- Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
-
- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
Download mafft
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
armhf | 700.1 kB | 7,144.0 kB | [list of files] |