Пакет: r-bioc-rsamtools (2.22.0+dfsg-1)

[ Източник: r-bioc-rsamtools  ]

Експериментален пакет

Предупреждение: Този пакет е от дистрибуцията experimental. Това означава, че е възможно да е нестабилен или да има грешки, а може дори и да предизвика загуба на данни. Прочетете информация за промените и останалата документация преди да го използвате.

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

This package provides an interface to the 'samtools', 'bcftools', and 'tabix' utilities for manipulating SAM (Sequence Alignment / Map), binary variant call (BCF) and compressed indexed tab-delimited (tabix) files.

Други пакети, свързани с r-bioc-rsamtools

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)

  easy-to-use client-side URL transfer library (OpenSSL flavour)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не riscv64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: r-api-4.0

  Пакетът не е наличен

• dep: r-api-bioc-3.20

  виртуален пакет, предлаган от r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 2.99.1)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-bitops

  GNU R package implementing bitwise operations

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  compression library - runtime

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)

  GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Изтегляне на r-bioc-rsamtools

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	3 514,3 кБ	5 655,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	3 479,9 кБ	5 644,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	3 469,2 кБ	5 831,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	3 553,4 кБ	6 231,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	3 563,9 кБ	6 092,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	3 525,9 кБ	5 435,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	3 528,2 кБ	5 795,0 кБ	[списък на файловете]