Пакет: repeatmasker-recon (1.08-6)

[ Източник: repeatmasker-recon  ]

finds repeat families from biological sequences

The RECON package implements a de novo algorithm for the identification of repeat families from biological sequences.

The program implements an approach for the de novo identification and classification of repeat sequence families that is based on extensions to the usual approach of single linkage clustering of local pairwise alignments between genomic sequences. The extensions use multiple alignment information to define the boundaries of individual copies of the repeats and to distinguish homologous but distinct repeat element families. When tested on the human genome, this approach was able to properly identify and group known transposable elements. The program, should be useful for first-pass automatic classification of repeats in newly sequenced genomes.

Други пакети, свързани с repeatmasker-recon

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [не arm64, ppc64el]

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Изтегляне на repeatmasker-recon

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	83,1 кБ	460,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	81,3 кБ	452,0 кБ	[списък на файловете]
armel	80,6 кБ	447,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	78,0 кБ	407,0 кБ	[списък на файловете]
i386	85,3 кБ	471,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	84,4 кБ	481,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	84,4 кБ	475,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	85,6 кБ	656,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	81,3 кБ	456,0 кБ	[списък на файловете]