套件：sibsim4（0.20-5 以及其他的）

[ 原始碼： sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 實做語言: implemented-in::c, interface::commandline, 角色: 程式, 範圍: 實用程式, Purpose: use::TODO, use::comparing, 搜尋, 支援的格式: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, 處理: 需要一個額外的標籤

其他與 sibsim4 有關的套件

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

下載 sibsim4

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	0.20-5	30。9 kB	85。0 kB	[檔案列表]
amd64	0.20-5	29。7 kB	73。0 kB	[檔案列表]
arm64	0.20-5+b1	28。4 kB	85。0 kB	[檔案列表]
armel	0.20-5	27。5 kB	72。0 kB	[檔案列表]
armhf	0.20-5	26。2 kB	56。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	0.20-5	28。8 kB	69。0 kB	[檔案列表]
i386	0.20-5	30。8 kB	80。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	0.20-5	36。3 kB	112。0 kB	[檔案列表]
loong64 （非官方移植版）	0.20-5	28。6 kB	84。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	0.20-5	25。6 kB	60。0 kB	[檔案列表]
mips64el	0.20-5	29。3 kB	79。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.20-5	31。9 kB	150。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	0.20-5	31。9 kB	85。0 kB	[檔案列表]
riscv64	0.20-5+b1	30。7 kB	65。0 kB	[檔案列表]
s390x	0.20-5	30。5 kB	77。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	0.20-5	29。5 kB	60。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.20-5	27。7 kB	78。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	0.20-5	28。5 kB	72。0 kB	[檔案列表]