Пакет: sibsim4 (0.20-5 и другие)

[ Источник: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::TODO, use::comparing, Поиск, Поддерживаемые форматы: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

Загрузка sibsim4

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.20-5	30,9 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.20-5	29,7 Кб	73,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.20-5+b1	28,4 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
armel	0.20-5	27,5 Кб	72,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.20-5	26,2 Кб	56,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.20-5	28,8 Кб	69,0 Кб	[список файлов]
i386	0.20-5	30,8 Кб	80,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.20-5	36,3 Кб	112,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	0.20-5	28,6 Кб	84,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.20-5	25,6 Кб	60,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.20-5	29,3 Кб	79,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.20-5	31,9 Кб	150,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.20-5	31,9 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.20-5+b1	30,7 Кб	65,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.20-5	30,5 Кб	77,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.20-5	29,5 Кб	60,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.20-5	27,7 Кб	78,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.20-5	28,5 Кб	72,0 Кб	[список файлов]